RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395038.6

SOS1-201, Transcript of SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SOS1, Length 4,123 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1-201ENST00000395038 ATP6AP2O75787 350 aa6.29□□□□□ -1.4
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SOS1-201ENST00000395038 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SOS1-201ENST00000395038 GRK4P32298 578 aa6.29□□□□□ -1.4
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SOS1-201ENST00000395038 IL10RBQ08334 325 aa6.29□□□□□ -1.4
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SOS1-201ENST00000395038 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SOS1-201ENST00000395038 RASAL3Q86YV0 1011 aa6.29□□□□□ -1.4
SOS1-201ENST00000395038 SCN4BQ8IWT1 228 aa6.29□□□□□ -1.4
SOS1-201ENST00000395038 CLYBLQ8N0X4 340 aa6.29□□□□□ -1.4
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SOS1-201ENST00000395038 CYP2S1Q96SQ9 504 aa6.29□□□□□ -1.4
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SOS1-201ENST00000395038 SP110Q9HB58 689 aa6.29□□□□□ -1.4
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SOS1-201ENST00000395038 VNN2O95498 520 aa6.28□□□□□ -1.4
SOS1-201ENST00000395038 PRR35P0CG20 571 aa6.28□□□□□ -1.4
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SOS1-201ENST00000395038 CDH13P55290 713 aa6.28□□□□□ -1.4
SOS1-201ENST00000395038 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SOS1-201ENST00000395038 NHSL2Q5HYW2 709 aa6.28□□□□□ -1.4
SOS1-201ENST00000395038 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.28□□□□□ -1.4
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SOS1-201ENST00000395038 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6.28□□□□□ -1.4
SOS1-201ENST00000395038 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SOS1-201ENST00000395038 OR52K2Q8NGK3 314 aa6.28□□□□□ -1.4
SOS1-201ENST00000395038 OR13C4Q8NGS5 318 aa6.28□□□□□ -1.4
SOS1-201ENST00000395038 OR6P1Q8NGX9 317 aa6.28□□□□□ -1.4
SOS1-201ENST00000395038 RIN3Q8TB24 985 aa6.28□□□□□ -1.4
SOS1-201ENST00000395038 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.28□□□□□ -1.4
SOS1-201ENST00000395038 TRIB2Q92519 343 aa6.28□□□□□ -1.4
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SOS1-201ENST00000395038 EPS15L1Q9UBC2 864 aa6.28□□□□□ -1.4
SOS1-201ENST00000395038 CEPT1Q9Y6K0 416 aa6.28□□□□□ -1.4
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SOS1-201ENST00000395038 BBIP1A8MTZ0 92 aa6.28□□□□□ -1.4
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SOS1-201ENST00000395038 MATN4O95460 622 aa6.28□□□□□ -1.4
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SOS1-201ENST00000395038 BMP2P12643 396 aa6.28□□□□□ -1.4
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