RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 VPS37BQ9H9H4 285 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KIF9Q9HAQ2 790 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CRLF2Q9HC73 371 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SLC39A2Q9NP94 309 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DTX4Q9Y2E6 619 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MYCBP2O75592 4640 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MYH13Q9UKX3 1938 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC169A6NNP5 214 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ADCY5O95622 1261 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DBHP09172 617 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HMOX1P09601 288 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZGLP1P0C6A0 271 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SRCP12931 536 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CLK3P49761 638 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CDH15P55291 814 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RIPK4P57078 832 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GPC5P78333 572 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KCNMA1Q12791 1236 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 NPRL3Q12980 569 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KIR3DS1Q14943 382 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PCGF3Q3KNV8 242 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZMAT1Q5H9K5 638 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 LCE2CQ5TA81 110 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 FAM160B1Q5W0V3 765 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 OLFML2AQ68BL7 652 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 NOTUMQ6P988 496 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ADCK1Q86TW2 530 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 WDR49Q8IV35 697 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TUSC5Q8IXB3 177 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CCHCR1Q8TD31 782 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 FAM216AQ8WUB2 273 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 WDR60Q8WVS4 1066 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CPT1BQ92523 772 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 IP6K1Q92551 441 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC114Q96M63 670 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 EFHD1Q9BUP0 239 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SLC32A1Q9H598 525 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 LZTFL1Q9NQ48 299 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZSCAN32Q9NX65 697 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 COQ3Q9NZJ6 369 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RBPJLQ9UBG7 517 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GRID1Q9ULK0 1009 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 JRKLQ9Y4A0 524 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HTR3EA5X5Y0 456 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 C2orf78A6NCI8 922 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 WDR46O15213 610 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GPC4O75487 556 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 VCLP18206 1134 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CD9P21926 228 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GCH1P30793 250 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MAGEA4P43358 317 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 STX1BP61266 288 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GRIN1Q05586 938 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ELP6Q0PNE2 266 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 LRMPQ12912 555 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SGMS1Q86VZ5 419 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DNAJC10Q8IXB1 793 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 LILRA2Q8N149 483 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HIPK4Q8NE63 616 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC110Q8TBZ0 833 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TRPC4APQ8TEL6 797 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HSPH1Q92598 858 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CLMNQ96JQ2 1002 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 NLRP4Q96MN2 994 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 NECTIN4Q96NY8 510 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KLHL4Q9C0H6 718 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 NYXQ9GZU5 481 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 THAP2Q9H0W7 228 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 VEZTQ9HBM0 779 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PAG1Q9NWQ8 432 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 BTG4Q9NY30 223 aa2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms