RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363172.2

U3.48-201, humanhuman

BASIC

Gene U3, Length 216 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3.48-201ENST00000363172 PARD3BQ8TEW8 1205 aa7.56□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 SHC3Q92529 594 aa7.56□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 OTUB2Q96DC9 234 aa7.56□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 PCED1BQ96HM7 432 aa7.56□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 HPDLQ96IR7 371 aa7.56□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 CEP295NLQ96MC4 621 aa7.56□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 SH3GL2Q99962 352 aa7.56□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 SYT3Q9BQG1 590 aa7.56□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa7.56□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 SNX25Q9H3E2 840 aa7.56□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 EPB41L5Q9HCM4 733 aa7.56□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 SPHK2Q9NRA0 654 aa7.56□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 ASB1Q9Y576 335 aa7.56□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 RAD54BQ9Y620 910 aa7.56□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 PTPRBP23467 1997 aa7.56□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 NBEAQ8NFP9 2946 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 PTPRJQ12913 1337 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 A0A1W2PQF6 199 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 E2F8A0AVK6 867 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 ZNF233A6NK53 670 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 TRIM24O15164 1050 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 COCHO43405 550 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 CER1O95813 267 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 IVLP07476 585 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 CFPP27918 469 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 ACTN2P35609 894 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 GLRBP48167 497 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 LMAN1P49257 510 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 DNA2P51530 1060 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 CACNA2D1P54289 1103 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 GCNT1Q02742 428 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 CYP24A1Q07973 514 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 ZNF677Q86XU0 584 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 CBWD2Q8IUF1 395 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 ARHGEF19Q8IW93 802 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 ZZZ3Q8IYH5 903 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 LINC01356Q8N9X3 169 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 OR5B17Q8NGF7 314 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 OR6B3Q8NGW1 331 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 FAM76AQ8TAV0 307 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 CALML6Q8TD86 181 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 CHTF18Q8WVB6 975 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 ASB15Q8WXK1 588 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 IFT81Q8WYA0 676 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 LRRC45Q96CN5 670 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 C8orf48Q96LL4 319 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 RUNDC3BQ96NL0 473 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 ACOX2Q99424 681 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 TTC1Q99614 292 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 ELOVL4Q9GZR5 314 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 NACA2Q9H009 215 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 RAB17Q9H0T7 212 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 DPEP3Q9H4B8 488 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 FAM204AQ9H8W3 233 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 FAM114A2Q9NRY5 505 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 RAB20Q9NX57 234 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 UVRAGQ9P2Y5 699 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 NFU1Q9UMS0 254 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 SPO11Q9Y5K1 396 aa7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 URB1O60287 2271 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 A0A1B0GTW7 788 aa7.54□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 GOLGA6CA6NDK9 693 aa7.54□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 AGPSO00116 658 aa7.54□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 CLDN5O00501 218 aa7.54□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 RAD51CO43502 376 aa7.54□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 FTLP02792 175 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 PRB1P04280 392 aa7.54□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 GOLGA6DP0CG33 693 aa7.54□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 ABCB4P21439 1286 aa7.54□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 YWHAQP27348 245 aa7.54□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 CD6P30203 668 aa7.54□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 USP8P40818 1118 aa7.54□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 ABCG1P45844 678 aa7.54□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 LSSP48449 732 aa7.54□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 CARSP49589 748 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 AP3M2P53677 418 aa7.54□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 SLC5A3P53794 718 aa7.54□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 CDR2Q01850 454 aa7.54□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 STARD3Q14849 445 aa7.54□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 PSMD6Q15008 389 aa7.54□□□□□ -1.2
U3.48-201ENST00000363172 CCDC157Q569K6 752 aa7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms