RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 LINC00032P0C843 101 aa25.29■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 GFAPP14136 432 aa25.29■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 PAMP19021 973 aa25.29■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 ECT2LQ008S8 904 aa25.29■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 IHHQ14623 411 aa25.29■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 GEN1Q17RS7 908 aa25.29■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 FUT11Q495W5 492 aa25.29■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 RAB41Q5JT25 222 aa25.29■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 OR13J1Q8NGT2 312 aa25.29■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 SEPT8Q92599 483 aa25.29■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 MID1IP1Q9NPA3 183 aa25.29■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 TBC1D23Q9NUY8 699 aa25.29■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 BLOC1S6Q9UL45 172 aa25.29■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 VWA7Q9Y334 891 aa25.29■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 KCTD3Q9Y597 815 aa25.29■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 KANSL1LA0AUZ9 987 aa25.28■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 ANGPT2O15123 496 aa25.28■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 GEMP55040 296 aa25.28■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 DIO3P55073 304 aa25.28■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 WNT3AP56704 352 aa25.28■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 MAXP61244 160 aa25.28■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 LRRC58Q96CX6 371 aa25.28■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 FEM1CQ96JP0 617 aa25.28■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa25.28■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 SLAMF8Q9P0V8 285 aa25.28■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 IPPQ9Y573 584 aa25.28■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 KPNA6O60684 536 aa25.28■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 HSD17B1P14061 328 aa25.28■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 ELK4P28324 431 aa25.28■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 ATP4BP51164 291 aa25.28■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 ATP1A4Q13733 1029 aa25.28■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 DCDC5Q6ZRR9 648 aa25.28■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 TRPV3Q8NET8 790 aa25.28■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 TWIST2Q8WVJ9 160 aa25.28■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 DNAJB3Q8WWF6 145 aa25.28■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 SGCDQ92629 289 aa25.28■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 PFDN4Q9NQP4 134 aa25.28■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa25.28■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 ACTR3BQ9P1U1 418 aa25.28■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 MATN3O15232 486 aa25.27■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 MMP3P08254 477 aa25.27■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 SMPD1P17405 629 aa25.27■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 PGFP49763 221 aa25.27■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 BMXP51813 675 aa25.27■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 C21orf59P57076 290 aa25.27■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 XKR4Q5GH76 650 aa25.27■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa25.27■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 MINDY1Q8N5J2 469 aa25.27■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 COX4I2Q96KJ9 171 aa25.27■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 SENP8Q96LD8 212 aa25.27■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 TMEM74Q96NL1 305 aa25.27■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 MPP6Q9NZW5 540 aa25.27■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 NUDT5Q9UKK9 219 aa25.27■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 NDUFAF1Q9Y375 327 aa25.27■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 K7EPI3 171 aa25.27■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 TRAF2Q12933 501 aa25.27■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 SLC22A9Q8IVM8 553 aa25.27■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 CLYBLQ8N0X4 340 aa25.27■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 DHRSXQ8N5I4 330 aa25.27■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 SLC52A3Q9NQ40 469 aa25.27■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 LTBP3Q9NS15 1303 aa25.27■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa25.27■■□□□ 1.64
SENP3-201ENST00000321337 MSI1O43347 362 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 CAPGP40121 348 aa25.26■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 GSK3BP49841 420 aa25.26■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 MLLT10P55197 1068 aa25.26■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 ARTNQ5T4W7 220 aa25.26■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 MIER2Q8N344 545 aa25.26■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 OR6P1Q8NGX9 317 aa25.26■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 BORCS5Q969J3 196 aa25.26■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 SEPHS2Q99611 448 aa25.26■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 COQ6Q9Y2Z9 468 aa25.26■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa25.26■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 ZNF236Q9UL36 1845 aa25.26■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 TCRBV5S2A0A599 114 aa25.26■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 ASPDHA6ND91 283 aa25.26■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 UBXN8O00124 270 aa25.26■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 CLCN5P51795 746 aa25.26■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 RELAQ04206 551 aa25.26■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 PTPRCAPQ14761 206 aa25.26■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 CILP2Q8IUL8 1156 aa25.26■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 ACDQ96AP0 544 aa25.26■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 TMEM125Q96AQ2 219 aa25.26■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 L3HYPDHQ96EM0 354 aa25.26■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 KATNBL1Q9H079 304 aa25.26■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 SELENONQ9NZV5 590 aa25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms