RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259351.9

RALGPS1-201, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RALGPS1, Length 6,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-201ENST00000259351 WDR60Q8WVS4 1066 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 COQ7Q99807 217 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 RTKNQ9BST9 563 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 TTYH3Q9C0H2 523 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 PTGFRNQ9P2B2 879 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 ADGRE2Q9UHX3 823 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 NR2E3Q9Y5X4 410 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 TAF4O00268 1085 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 SIN3BO75182 1162 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 AMD1P17707 334 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 TRIM32Q13049 653 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 MED22Q15528 200 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 GALNT5Q7Z7M9 940 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 PPTC7Q8NI37 304 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 ERGIC3Q9Y282 383 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 AGPSO00116 658 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 CCNA2P20248 432 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 MAGP20916 626 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 PARGQ86W56 976 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 DSELQ8IZU8 1212 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 CAPSLQ8WWF8 208 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 CXorf40BQ96DE9 158 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 SOHLH2Q9NX45 425 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 DNM1LO00429 736 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 ADAMTS3O15072 1205 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 KPNA5O15131 536 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 PLSCR1O15162 318 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 PRG2P13727 222 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 CXCR2P25025 360 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 NDUFV1P49821 464 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 SPIRE1Q08AE8 756 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 AAGABQ6PD74 315 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 RGL4Q8IZJ4 473 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 TRIM8Q9BZR9 551 aa12.88□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 TOMM20Q15388 145 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 AADATQ8N5Z0 425 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 SLC4A11Q8NBS3 891 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 FLCNQ8NFG4 579 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 OR52L1Q8NGH7 329 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 FAIM2Q9BWQ8 316 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 PDZD7Q9H5P4 517 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 RASSF1Q9NS23 344 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 CMTM6Q9NX76 183 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 RAB23Q9ULC3 237 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 VPS4AQ9UN37 437 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 OR10H1Q9Y4A9 318 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 UQCRBP14927 111 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 TPSB2P20231 275 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 CTNNB1P35222 781 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 TPSAB1Q15661 275 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 RFX4Q33E94 735 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 DUSP28Q4G0W2 176 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 ARMC3Q5W041 872 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 SLC47A1Q96FL8 570 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 S100A14Q9HCY8 104 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 C1RP00736 705 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 RPL4P36578 427 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 ZNF460Q14592 562 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 ITCHQ96J02 903 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 GPR21Q99679 349 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 HSD3B7Q9H2F3 369 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 ARHGEF4Q9NR80 690 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 PSMD13Q9UNM6 376 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 AHCYL1O43865 530 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 MMP3P08254 477 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 CHRNB2P17787 502 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 SLC5A3P53794 718 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 GDF10P55107 478 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 BNIP1Q12981 228 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 RNF220Q5VTB9 566 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 ADGRD1Q6QNK2 874 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 ZNF567Q8N184 647 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 NMUR1Q9HB89 426 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 CDH22Q9UJ99 828 aa12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 EFR3BQ9Y2G0 817 aa12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms