RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 LCA5LO95447 670 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 GOT1P17174 413 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SLC6A2P23975 617 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CCNFP41002 786 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 GRIA3P42263 894 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 GCNT6Q5T4J0 391 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 HIPK1Q86Z02 1210 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ZNF540Q8NDQ6 660 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ADCY4Q8NFM4 1077 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SEMA4DQ92854 862 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CRELD1Q96HD1 420 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 C7orf26Q96N11 449 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RERGLQ9H628 205 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 IGFLR1Q9H665 355 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 EXO5Q9H790 373 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 FAM105AQ9NUU6 356 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 STOML2Q9UJZ1 356 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RAB26Q9ULW5 256 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ERVW-1Q9UQF0 538 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PLIN4Q96Q06 1357 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 DHRS12A0PJE2 317 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 G3V2T6 193 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 MDM4O15151 490 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 DHX15O43143 795 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 SLC28A2O43868 658 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 TULP3O75386 442 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 PGM3O95394 542 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 CBX6O95503 412 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 RPL5P46777 297 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 CDK9P50750 372 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 ADARP55265 1226 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 SMCO1Q147U7 214 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 PTPRNQ16849 979 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 CPTPQ5TA50 214 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 C17orf64Q86WR6 236 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 XYLT1Q86Y38 959 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 UBASH3BQ8TF42 649 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 AZIN2Q96A70 460 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 RNF208Q9H0X6 261 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 PCDH18Q9HCL0 1135 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 CKLFQ9UBR5 152 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 PHF11Q9UIL8 331 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 NUDT5Q9UKK9 219 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 IRAK3Q9Y616 596 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 MAGEB3O15480 346 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 CMPK1P30085 196 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 NOGQ13253 232 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 ZSWIM7Q19AV6 140 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 SMYD5Q6GMV2 418 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 NATD1Q8N6N6 113 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 POU5F2Q8N7G0 328 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 PANX1Q96RD7 426 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 GULP1Q9UBP9 304 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 VWA7Q9Y334 891 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 IPO13O94829 963 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 C8GP07360 202 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 BPGMP07738 259 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 ARHGDIBP52566 201 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 AP1S1P61966 158 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 TUBA4AP68366 448 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 RALGDSQ12967 914 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 DUSP28Q4G0W2 176 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 CCDC157Q569K6 752 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 PYDC2Q56P42 97 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 RNF44Q7L0R7 432 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 CUZD1Q86UP6 607 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 CCDC36Q8IYA8 594 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 UNC5BQ8IZJ1 945 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 SLC4A11Q8NBS3 891 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 ROPN1LQ96C74 230 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 AP2M1Q96CW1 435 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 DSN1Q9H410 356 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 SGK2Q9HBY8 427 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 PCDH12Q9NPG4 1184 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 ARMCX1Q9P291 453 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 FETUBQ9UGM5 382 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 PTPRJQ12913 1337 aa7.21□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 MYOM1P52179 1685 aa7.2□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 C5orf60A6NFR6 353 aa7.2□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 CILPO75339 1184 aa7.2□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 PAGE1O75459 146 aa7.2□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 DRD4P21917 467 aa7.2□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 HSPA14Q0VDF9 509 aa7.2□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms