RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000172332.3

Ccdc71l-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

APPRIS P1 BASIC

Gene Ccdc71l, Length 4,240 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Rps27lQ6ZWY3 84 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Rhbdf2Q80WQ6 827 aa15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Lrif1Q8CDD9 755 aa15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Brd8Q8R3B7 951 aa15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Tcf7l2Q924A0 459 aa15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Katna1Q9WV86 491 aa15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Zbtb11G5E8B9 1050 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Gm2888K7N746 267 aa15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 St14P56677 855 aa15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Rps7P62082 194 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Olfr464Q5SW48 313 aa15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Hesx1Q61658 185 aa15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Reep1Q8BGH4 201 aa15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Kctd12bQ8C7J6 292 aa15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Trim8Q99PJ2 551 aa15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Tmed11Q9D2R4 215 aa15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Nos1apQ9D3A8 503 aa15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 HaspinQ9Z0R0 754 aa15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Gli3Q61602 1583 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 CkmP07310 381 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Rhox5P52651 210 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Dsc2P55292 902 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Htr4P97288 388 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 HadhQ61425 314 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Ddx5Q61656 614 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Jak2Q62120 1129 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 GapdhsQ64467 440 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 MregQ6NVG5 214 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Tas2r129Q7M709 320 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Vtcn1Q7TSP5 283 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Bmp3Q8BHE5 468 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Cpsf7Q8BTV2 471 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Clec4a3Q8JZX6 237 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Golm1Q91XA2 393 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 MmadhcQ99LS1 296 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Cyp4f13Q99N19 523 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 ArskQ9D2L1 553 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Tmem80Q9D3H0 123 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 CpqQ9WVJ3 470 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Trim15G3UY57 292 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Erp29P57759 262 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Lpcat1Q3TFD2 534 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Q3UTZ3 580 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Phf24Q80TL4 400 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 GskipQ8BGR8 139 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Zbtb46Q8BID6 600 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Hus1Q8BQY8 280 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Fam221bQ8C627 487 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Fam110bQ8C739 366 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Ipo13Q8K0C1 963 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Gsto2Q8K2Q2 248 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Traf7Q922B6 594 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Slc13a2Q9ES88 586 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Pias4Q9JM05 507 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Myh4Q5SX39 1939 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Gm10720D3Z1I5 223 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Slc4a5E9Q3M5 1116 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Vmn2r14E9Q759 848 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Gm7073E9QAS1 335 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Calhm3J3QMI4 347 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 KlO35082 1014 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 UcmaQ14BU0 138 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Spc25Q3UA16 226 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Kctd21Q3URF8 260 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Zbtb2Q3V3W4 514 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Eps15l1Q60902 907 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Six3Q62233 333 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Znf280cQ6P3Y5 742 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Olfr533Q7TRT7 320 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Trim50Q810I2 483 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Cxcr1Q810W6 351 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Elmo1Q8BPU7 727 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Defb19Q8K3I8 83 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Stk32cQ8QZV4 488 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Actr3Q99JY9 418 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Rnf146Q9CZW6 359 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 MispQ9D279 648 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Spata31d1aE9QA35 1336 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Als2Q920R0 1651 aa15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Znfx1Q8R151 1909 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Sppl2cA2A6C4 690 aa15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 JhyE9Q793 770 aa15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Gm10477F6SW83 55 aa15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 OstnP61364 130 aa15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Zmym5Q3U2E2 627 aa15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Gm4951Q3UED7 406 aa15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Eif2b4Q61749 524 aa15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Olfr1467Q8VFW1 308 aa15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Stard13Q923Q2 1113 aa15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Lrrc4Q99PH1 652 aa15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Paqr5Q9DCU0 330 aa15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Sars2Q9JJL8 518 aa15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Sae1Q9R1T2 350 aa15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Phlpp1Q8CHE4 1687 aa15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Gm6509A0A0J9YUV1 481 aa15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Kctd17E0CYQ0 296 aa15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Gm6351K9J7D1 481 aa15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Vps45P97390 570 aa15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Q32M26 199 aa15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 AbrQ5SSL4 859 aa15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 169.1 ms