RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ripply1Q2WG77 201 aa16.08■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccdc85aQ5SP85 500 aa16.08■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 StyxQ60969 223 aa16.08■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Epb41l5Q8BGS1 731 aa16.08■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Stx16Q8BVI5 326 aa16.08■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Il23aQ9EQ14 196 aa16.08■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 FancfE9Q5Z5 343 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Clec2lP0C7M9 211 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Traf2P39429 501 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ctps2P70303 586 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem102Q3UPR7 509 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Clec2eQ80XD9 204 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 4933402J07RikQ8BHX0 270 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 UnkQ8BL48 810 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sec22cQ8BXT9 303 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tbl3Q8C4J7 801 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PclafQ9CQX4 110 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Spock2Q9ER58 423 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr671A0A1B0GSN5 317 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ttll8A4Q9F1 832 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sult2a6B2RVI8 285 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adamts14E9PX39 1209 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppp3cbP48453 525 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Thrap3Q569Z6 951 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mrm3Q5ND52 418 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf423Q80TS5 1292 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GancQ8BVW0 898 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PvrQ8K094 408 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gramd1aQ8VEF1 722 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zdhhc13Q9CWU2 622 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem233D3Z1U7 110 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr726E9Q8X3 321 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gsta1P13745 223 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr725Q05A45 321 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyb5r2Q3KNK3 276 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpatch4Q3TFK5 415 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 InipQ3TXT3 104 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf865Q3U3I9 1058 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rabl6Q5U3K5 725 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Flot2Q60634 428 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gsta1Q6P8Q0 223 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr20Q7TRX9 314 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp2c70Q91W64 489 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Traf7Q922B6 594 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem86aQ9D8N3 241 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fads3Q9JJE7 449 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trpc4apQ9JLV2 797 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fiz1Q9WTJ4 500 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mbtps1Q9WTZ2 1052 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc2a5Q9WV38 501 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adgra2Q91ZV8 1336 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TriqkB2B9E1 86 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 1700011I03RikE9PYL8 271 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 WasP70315 520 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adra1dP97714 562 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp3a13Q64464 503 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rtl3Q6P1Y1 553 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Taf1cQ6PDZ2 836 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Letm2Q7TNU7 480 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tex13c3Q810P0 219 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp617Q91WM0 559 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vps35Q9EQH3 796 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mgea5Q9EQQ9 916 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr596F8VQ26 312 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r55G3UWZ4 781 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r53L7N473 806 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dmp1O55188 503 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fpr-rs3O88537 343 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kcnc1P15388 511 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Anxa5P48036 319 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kctd21Q3URF8 260 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tfap2cQ61312 449 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Krt72Q6IME9 520 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Asrgl1Q8C0M9 326 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mob2Q8VI63 235 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NpntQ91V88 561 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 H2-M9O19442 342 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp27b1O35084 507 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ClppO88696 272 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CcnoP0C242 352 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lim2P56563 173 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rpl26P61255 145 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kir3dl1P83555 432 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Smarcd1Q61466 515 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ugt2a1Q80X89 528 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MtbpQ8BJS8 894 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Stk-ps2Q8C0V7 499 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppp4r4Q8C0Y0 875 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Acsm2Q8K0L3 575 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ifi44lQ9BDB7 447 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sike1Q9CPR7 207 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 S100a14Q9D2Q8 104 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NfkbizQ9EST8 728 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm3259D3YUK0 475 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Krt83E9Q1Y9 479 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pou2f2Q00196 463 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Krt2Q3TTY5 707 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Smyd5Q3TYX3 416 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Itih2Q61703 946 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gba2Q69ZF3 918 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10.5 ms