RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mucl2P02815 138 aa22.7■■□□□ 1.22
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pcdh8Q7TSK3 1070 aa22.69■■□□□ 1.22
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 LssQ8BLN5 733 aa22.69■■□□□ 1.22
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc28aQ8CEI3 192 aa22.69■■□□□ 1.22
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Adam24Q9R160 761 aa22.69■■□□□ 1.22
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wdfy4E9Q2M9 3149 aa22.68■■□□□ 1.22
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn2r65G3X931 845 aa22.68■■□□□ 1.22
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mthfd2P18155 350 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nkx2-5P42582 318 aa22.68■■□□□ 1.22
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mmp7Q10738 264 aa22.68■■□□□ 1.22
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PikfyveQ9Z1T6 2097 aa22.68■■□□□ 1.22
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ssc4dA1L0T3 586 aa22.67■■□□□ 1.22
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sox18P43680 377 aa22.66■■□□□ 1.22
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pde1bQ01065 535 aa22.66■■□□□ 1.22
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 A1bgQ19LI2 512 aa22.66■■□□□ 1.22
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam98aQ3TJZ6 515 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr667Q7TRP4 326 aa22.66■■□□□ 1.22
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dhx33Q80VY9 698 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Bpifb2Q8C1E1 462 aa22.66■■□□□ 1.22
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Agap3Q8VHH5 910 aa22.66■■□□□ 1.22
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