RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	CKAP5	Q14008	2032 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	MYMK	A6NI61	221 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	TIPRL	O75663	272 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	HOXC6	P09630	235 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	RARG	P13631	454 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	KRT10	P13645	584 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	BDNF	P23560	247 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	PRAME	P78395	509 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	SORD	Q00796	357 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	DSC1	Q08554	894 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	TRAF3	Q13114	568 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	NEDD9	Q14511	834 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	WDR78	Q5VTH9	848 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	JADE1	Q6IE81	842 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	DPPA4	Q7L190	304 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	TTC39C	Q8N584	583 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	MIB2	Q96AX9	1013 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	TIGD1	Q96MW7	591 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	SH3GL2	Q99962	352 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	SYNC	Q9H7C4	482 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	MMP25	Q9NPA2	562 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	MYO6	Q9UM54	1294 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	GPR34	Q9UPC5	381 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175		A0A0U1RQJ8	604 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175		A6NCN8	305 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	VCY	O14598	125 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	ZIC3	O60481	467 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	NDUFS3	O75489	264 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	DAB1	O75553	588 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	SLC25A12	O75746	678 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	GFPT2	O94808	682 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	BMP15	O95972	392 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	GLUD1	P00367	558 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	ALOX12	P18054	663 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	GABRB1	P18505	474 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	SCP2	P22307	547 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	HOXC9	P31274	260 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	GLUD2	P49448	558 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	CLCN3	P51790	818 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	ZBED6	P86452	979 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	BNC1	Q01954	994 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	CREB5	Q02930	508 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	ACVR2B	Q13705	512 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	CRYM	Q14894	314 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	ADIPOQ	Q15848	244 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	PMS2CL	Q68D20	193 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	PHF21B	Q96EK2	531 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	PGAM5	Q96HS1	289 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	CMTM3	Q96MX0	182 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	ACOX2	Q99424	681 aa		3.13	□□□□□ -1.91

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