RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	RMDN1	Q96DB5	314 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	PKP2	Q99959	881 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	DRGX	A6NNA5	263 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152		F5H5T6	163 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152		H3BMM5	538 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	SYN3	O14994	580 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	PRAMEF11	O60813	436 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	DNAJA2	O60884	412 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	SERPINF2	P08697	491 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	CD1D	P15813	335 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	SLC6A4	P31645	630 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	FOXA1	P55317	472 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	SH3BP2	P78314	561 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	OR4D1	Q15615	310 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	UNC50	Q53HI1	259 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	REP15	Q6BDI9	236 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	OR4L1	Q8NH43	312 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	KCNA7	Q96RP8	456 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152		A0A0U1RQS6	177 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	VNN2	O95498	520 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	GFAP	P14136	432 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	MAGEA11	P43364	429 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	RGR	P47804	291 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	NKX3-2	P78367	333 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	STX5	Q13190	355 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	TLR1	Q15399	786 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	KIF19	Q2TAC6	998 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	CHSY3	Q70JA7	882 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	FAR2	Q96K12	515 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	PATJ	Q8NI35	1801 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	FAM92A	A1XBS5	289 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	ACOT8	O14734	319 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	CSPG5	O95196	566 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	ALDH2	P05091	517 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	FMO4	P31512	558 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	SQLE	Q14534	574 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	PTPRR	Q15256	657 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	TADA1	Q96BN2	335 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	C19orf60	Q96EN9	201 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	IL37	Q9NZH6	218 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	VPS28	Q9UK41	221 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
BRF1-222	ENST00000635152	FGF1	P05230	155 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BRF1-222	ENST00000635152	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
BRF1-222	ENST00000635152	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
BRF1-222	ENST00000635152	HLA-DPA1	P20036	260 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BRF1-222	ENST00000635152	FDXR	P22570	491 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BRF1-222	ENST00000635152	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
BRF1-222	ENST00000635152	SLC11A1	P49279	550 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BRF1-222	ENST00000635152	HERVK_113	P63132	956 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BRF1-222	ENST00000635152	FAM189B	P81408	668 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BRF1-222	ENST00000635152	ADGRE1	Q14246	886 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BRF1-222	ENST00000635152	IL23R	Q5VWK5	629 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BRF1-222	ENST00000635152	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BRF1-222	ENST00000635152	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
BRF1-222	ENST00000635152	TTC16	Q8NEE8	873 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BRF1-222	ENST00000635152	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BRF1-222	ENST00000635152	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BRF1-222	ENST00000635152	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
BRF1-222	ENST00000635152	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BRF1-222	ENST00000635152	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		13.08	□□□□□ -0.32

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