RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 WDR91A4D1P6 747 aa21.64■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 F5H423 210 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 BIRC5O15392 142 aa21.64■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 HLA-EP13747 358 aa21.64■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 CRADDP78560 199 aa21.64■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 ENPP2Q13822 863 aa21.64■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 BMPR2Q13873 1038 aa21.64■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 PITRM1Q5JRX3 1037 aa21.64■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 LMLNQ96KR4 655 aa21.64■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 LRRC37BQ96QE4 947 aa21.64■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 KLC4Q9NSK0 619 aa21.64■■□□□ 1.05
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SGMS1-210ENST00000619438 GGT7Q9UJ14 662 aa21.64■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 CHKBQ9Y259 395 aa21.64■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 USP1O94782 785 aa21.63■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 RHOBTB1O94844 696 aa21.63■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 ASLP04424 464 aa21.63■■□□□ 1.05
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SGMS1-210ENST00000619438 CDH4P55283 916 aa21.63■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 MROH9Q5TGP6 573 aa21.63■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 CYB5D1Q6P9G0 228 aa21.63■■□□□ 1.05
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SGMS1-210ENST00000619438 C11orf74Q86VG3 221 aa21.63■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 LRRC49Q8IUZ0 686 aa21.63■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa21.63■■□□□ 1.05
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SGMS1-210ENST00000619438 OR52K1Q8NGK4 314 aa21.63■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 TBC1D31Q96DN5 1066 aa21.63■■□□□ 1.05
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SGMS1-210ENST00000619438 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
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SGMS1-210ENST00000619438 SPTBN4Q9H254 2564 aa21.63■■□□□ 1.05
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SGMS1-210ENST00000619438 ZNF366Q8N895 744 aa21.63■■□□□ 1.05
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SGMS1-210ENST00000619438 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa21.63■■□□□ 1.05
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SGMS1-210ENST00000619438 TXLNGQ9NUQ3 528 aa21.63■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 SUN2Q9UH99 717 aa21.63■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa21.63■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa21.62■■□□□ 1.05
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SGMS1-210ENST00000619438 ZNF217O75362 1048 aa21.62■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 CNTN5O94779 1100 aa21.62■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 UNC5CO95185 931 aa21.62■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
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SGMS1-210ENST00000619438 ECT2LQ008S8 904 aa21.62■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 PLK5Q496M5 336 aa21.62■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 C5orf22Q49AR2 442 aa21.62■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 GRTP1Q5TC63 336 aa21.62■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 AFMIDQ63HM1 303 aa21.62■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 TMPRSS6Q8IU80 811 aa21.62■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 UNC5BQ8IZJ1 945 aa21.62■■□□□ 1.05
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SGMS1-210ENST00000619438 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 C7orf26Q96N11 449 aa21.62■■□□□ 1.05
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SGMS1-210ENST00000619438 MUC3BQ9H195 1237 aa21.62■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 SLC6A17Q9H1V8 727 aa21.62■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM245Q9H330 911 aa21.62■■□□□ 1.05
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SGMS1-210ENST00000619438 P2RY2P41231 377 aa21.61■■□□□ 1.05
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SGMS1-210ENST00000619438 ATG16L1Q676U5 607 aa21.61■■□□□ 1.05
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SGMS1-210ENST00000619438 IL22Q9GZX6 179 aa21.61■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 MYLK2Q9H1R3 596 aa21.61■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 CD248Q9HCU0 757 aa21.61■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 NPHS2Q9NP85 383 aa21.61■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 PCMTD2Q9NV79 361 aa21.61■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 ERVW-1Q9UQF0 538 aa21.61■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 ACADMP11310 421 aa21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 NQO1P15559 274 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SGMS1-210ENST00000619438 OR1E1P30953 314 aa21.6■■□□□ 1.05
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