RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	ACSL1	P33121	698 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	KRTAP10-9	P60411	292 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	CTXN1	P60606	82 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	TP53BP2	Q13625	1128 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	FUT11	Q495W5	492 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	XKR3	Q5GH77	459 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF529	Q6P280	563 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	TICAM2	Q86XR7	235 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	TERB1	Q8NA31	727 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	ASB10	Q8WXI3	467 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	GJA10	Q969M2	543 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	UROC1	Q96N76	676 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	GABRG3	Q99928	467 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	NUP58	Q9BVL2	599 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	VILL	O15195	856 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	FFAR2	O15552	330 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	CALM1	P0DP23	149 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	CALM2	P0DP24	149 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	CALM3	P0DP25	149 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	ACADM	P11310	421 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	HGF	P14210	728 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	CD1E	P15812	388 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	OXTR	P30559	389 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	SLC6A4	P31645	630 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	PTEN	P60484	403 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	RAP2B	P61225	183 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	ZXDB	P98169	803 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	FOXI1	Q12951	378 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	GPR17	Q13304	367 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	PRR16	Q569H4	304 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	ANO5	Q75V66	913 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	NAGS	Q8N159	534 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	FITM2	Q8N6M3	262 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	APPL2	Q8NEU8	664 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	LRRC15	Q8TF66	581 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	STON2	Q8WXE9	905 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	GDF3	Q9NR23	364 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	RRN3	Q9NYV6	651 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	DNM3	Q9UQ16	869 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768		A0A1B0GUA9	196 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	YKT6	O15498	198 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	TULP3	O75386	442 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	CYP21A2	P08686	494 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	PRKAR1A	P10644	381 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	FDXR	P22570	491 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	CD27	P26842	260 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	ART1	P52961	327 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	SLC16A1	P53985	500 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	HDAC4	P56524	1084 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	MPP3	Q13368	585 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	CAPS	Q13938	189 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	CYP2A13	Q16696	494 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	LNX2	Q8N448	690 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	IFI44	Q8TCB0	444 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	NRG4	Q8WWG1	115 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	JADE3	Q92613	823 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	HDAC10	Q969S8	669 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		5.1	□□□□□ -1.59

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