RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612199.4

SRGAP2B-204, Transcript of SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 2B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRGAP2B, Length 7,120 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2B-204ENST00000612199 SUSD6Q92537 303 aa9.49□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 VPS33AQ96AX1 596 aa9.49□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 ASB2Q96Q27 587 aa9.49□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 LGMNQ99538 433 aa9.49□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 DSN1Q9H410 356 aa9.49□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 ETNK2Q9NVF9 386 aa9.49□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 TAS2R13Q9NYV9 303 aa9.49□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 A0A0A0MRY4 1105 aa9.49□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 CCNDBP1O95273 360 aa9.49□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 ELNP15502 786 aa9.49□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 BRCC3P46736 316 aa9.49□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 RFT1Q96AA3 541 aa9.49□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 SPATA13Q96N96 652 aa9.49□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 PCDHB18PQ96TA0 734 aa9.49□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 BCAS3Q9H6U6 928 aa9.49□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 LIASO43766 372 aa9.49□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 TEAD4Q15561 434 aa9.49□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 PITRM1Q5JRX3 1037 aa9.49□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa9.49□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 GPR141Q7Z602 305 aa9.49□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 JOSD2Q8TAC2 188 aa9.49□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 CNBD2Q96M20 576 aa9.49□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 SLC28A3Q9HAS3 691 aa9.49□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 C3P01024 1663 aa9.49□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 MPPED1O15442 326 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 PIRTP0C851 137 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 GNSP15586 552 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 DRD4P21917 467 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 RPL22P35268 128 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 HNF4AP41235 474 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 SP140Q13342 867 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 DDR2Q16832 855 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 PRMT9Q6P2P2 845 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 FUKQ8N0W3 1084 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 PJA1Q8NG27 643 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 OR2L3Q8NG85 312 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 ART4Q93070 314 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 ART5Q96L15 291 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 SLC25A23Q9BV35 468 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 ENY2Q9NPA8 101 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 PHF11Q9UIL8 331 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 CROTQ9UKG9 612 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 CLEC4AQ9UMR7 237 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 OR5H15A6NDH6 313 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 OR5H14A6NHG9 310 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 OR5H1A6NKK0 313 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 TMEM114B3SHH9 223 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 FLT3LGP49771 235 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 CDKL1Q00532 357 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 NR6A1Q15406 480 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 ZNF280BQ86YH2 543 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 EID3Q8N140 333 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 STARD13Q9Y3M8 1113 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 C2CD2Q9Y426 696 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 CLPTM1O96005 669 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 ZCCHC18P0CG32 403 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 PTPN6P29350 595 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 FOXK1P85037 733 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 FBXO39Q8N4B4 442 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 ZNF398Q8TD17 642 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 GPR20Q99678 358 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 TCF25Q9BQ70 676 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 PRDM12Q9H4Q4 367 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 SLC15A5A6NIM6 579 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 SPIDRQ14159 915 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 ARPINQ7Z6K5 226 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 GATAD2BQ8WXI9 593 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 TCEAL3Q969E4 200 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 TBL1YQ9BQ87 522 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 BRD9Q9H8M2 597 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 BTBD7Q9P203 1132 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 CA5BQ9Y2D0 317 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 A0A075B6Q4 140 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 USP2O75604 605 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 CBX6O95503 412 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 ME2P23368 584 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 PTSQ03393 145 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 SMCO1Q147U7 214 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 GPR135Q8IZ08 494 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 TP53INP1Q96A56 240 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 CDHR5Q9HBB8 845 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 CSTBP04080 98 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 FMO4P31512 558 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 MMP13P45452 471 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 MAXP61244 160 aa9.48□□□□□ -0.89
SRGAP2B-204ENST00000612199 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms