RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 NLRP14Q86W24 1093 aa11.77□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 UNC45BQ8IWX7 931 aa11.77□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 CFAP61Q8NHU2 1237 aa11.77□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 PNPLA2Q96AD5 504 aa11.77□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 RUFY1Q96T51 708 aa11.77□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 HAUS4Q9H6D7 363 aa11.77□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 CROTQ9UKG9 612 aa11.77□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 IGLON5A6NGN9 336 aa11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 YJEFN3A6XGL0 299 aa11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 E7ENQ6 273 aa11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 TOR1BO14657 336 aa11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 SPTLC2O15270 562 aa11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 STK17BO94768 372 aa11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 VIMP08670 466 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 PBX1P40424 430 aa11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 ITGA1P56199 1179 aa11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 PER3P56645 1201 aa11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 DPYDQ12882 1025 aa11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 MIIPQ5JXC2 388 aa11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 CPZQ66K79 652 aa11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 KCTD16Q68DU8 428 aa11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 CHST14Q8NCH0 376 aa11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 OR4D9Q8NGE8 314 aa11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 SPATA3Q8NHX4 192 aa11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 RNF139Q8WU17 664 aa11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 FEM1CQ96JP0 617 aa11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 CCT8L2Q96SF2 557 aa11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 SLC25A23Q9BV35 468 aa11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 NT5C1AQ9BXI3 368 aa11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 SLAMF7Q9NQ25 335 aa11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 DYRK4Q9NR20 520 aa11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 FANCLQ9NW38 375 aa11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 HS3ST2Q9Y278 367 aa11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa11.76□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 TMEM200CA6NKL6 621 aa11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 LRRTM2O43300 516 aa11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 LRCH4O75427 683 aa11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 ATP6V1G2O95670 118 aa11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 RECKO95980 971 aa11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 PRNPP04156 253 aa11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 C8BP07358 591 aa11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 PAEPP09466 180 aa11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 SRCP12931 536 aa11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 P4HA1P13674 534 aa11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 CD99P14209 185 aa11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 BPIP17213 487 aa11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 NFKBIAP25963 317 aa11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 CD1CP29017 333 aa11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP11.75□□□□□ -0.537e-7■■■□□ 14.7
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HCG18-241ENST00000602290 CASP4P49662 377 aa11.75□□□□□ -0.53
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HCG18-241ENST00000602290 OR1D5P58170 312 aa11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 CLDN10P78369 228 aa11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 ART3Q13508 389 aa11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 ARHGEF7Q14155 803 aa11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 AMZ1Q400G9 498 aa11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 ACCSLQ4AC99 568 aa11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 RAD9BQ6WBX8 426 aa11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 TRIM74Q86UV6 250 aa11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 TRIM73Q86UV7 250 aa11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 HID1Q8IV36 788 aa11.75□□□□□ -0.53
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HCG18-241ENST00000602290 PDILTQ8N807 584 aa11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 OR52K2Q8NGK3 314 aa11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 LZICQ8WZA0 190 aa11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 SLC39A2Q9NP94 309 aa11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 ABCC13Q9NSE7 274 aa11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 MAP10Q9P2G4 905 aa11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 SLC25A13Q9UJS0 675 aa11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 OR51B4Q9Y5P0 310 aa11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 SAR1BQ9Y6B6 198 aa11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 WASF2Q9Y6W5 498 aa11.75□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa11.74□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 CDC14CA4D256 554 aa11.74□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 BNIP3LO60238 219 aa11.74□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 MFAP3LO75121 409 aa11.74□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 CEACAM4O75871 244 aa11.74□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 RASGRP1O95267 797 aa11.74□□□□□ -0.53
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