RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590466.2

UBXN6-206, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN6, Length 803 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-206ENST00000590466 NLGN3Q9NZ94 848 aa20.24■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 KLK13Q9UKR3 277 aa20.24■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa20.24■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 NEMP2A6NFY4 417 aa20.23■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 CAPN8A6NHC0 703 aa20.23■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 H3BM21 787 aa20.23■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa20.23■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 FFAR2O15552 330 aa20.23■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 APOC2P02655 101 aa20.23■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 CD68P34810 354 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 ACADVLP49748 655 aa20.23■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 EPHB1P54762 984 aa20.23■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 PTSQ03393 145 aa20.23■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 XRCC4Q13426 336 aa20.23■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 NOMO1Q15155 1222 aa20.23■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 SLC14A2Q15849 920 aa20.23■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 QPCTQ16769 361 aa20.23■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 ALG11Q2TAA5 492 aa20.23■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 LRRC66Q68CR7 880 aa20.23■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 KCTD16Q68DU8 428 aa20.23■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 AADACL2Q6P093 401 aa20.23■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 RFLNAQ6ZTI6 216 aa20.23■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 LPCAT1Q8NF37 534 aa20.23■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 BTN2A2Q8WVV5 523 aa20.23■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 NUS1Q96E22 293 aa20.23■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 OSBPL8Q9BZF1 889 aa20.23■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 AMFRQ9UKV5 643 aa20.23■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa20.23■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 HACD1B0YJ81 288 aa20.22■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 MTSS1O43312 755 aa20.22■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 AQP9O43315 295 aa20.22■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 GCATO75600 419 aa20.22■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 ZNF30P17039 623 aa20.22■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 CKMT2P17540 419 aa20.22■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 STC1P52823 247 aa20.22■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 KIAA1024LP59773 190 aa20.22■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 PPARDQ03181 441 aa20.22■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 ARHGEF7Q14155 803 aa20.22■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 DENND2CQ68D51 928 aa20.22■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 PEX26Q7Z412 305 aa20.22■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 SYCE1Q8N0S2 351 aa20.22■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 FAM181AQ8N9Y4 354 aa20.22■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 SPATA22Q8NHS9 363 aa20.22■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 LRRC61Q9BV99 259 aa20.22■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 LGR4Q9BXB1 951 aa20.22■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 CLPBQ9H078 707 aa20.22■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa20.22■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa20.21■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 TMEM202A6NGA9 273 aa20.21■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 ANKRD66B4E2M5 251 aa20.21■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 ARHGAP6O43182 974 aa20.21■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 FTCDO95954 541 aa20.21■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 C1SP09871 688 aa20.21■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 HTR1BP28222 390 aa20.21■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 TEAD1P28347 426 aa20.21■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 HK3P52790 923 aa20.21■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 SRP54P61011 504 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 DPTQ07507 201 aa20.21■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 FAXCQ5TGI0 409 aa20.21■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 ENPP7Q6UWV6 458 aa20.21■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 LRRC8AQ8IWT6 810 aa20.21■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 CCDC112Q8NEF3 446 aa20.21■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 ACTL9Q8TC94 416 aa20.21■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 LMX1AQ8TE12 382 aa20.21■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 WDR92Q96MX6 357 aa20.21■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa20.21■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 TEX101Q9BY14 249 aa20.21■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa20.21■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 SLC13A1Q9BZW2 595 aa20.21■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 SPASTQ9UBP0 616 aa20.21■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 DNPEPQ9ULA0 475 aa20.21■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 MSRB2Q9Y3D2 182 aa20.21■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 U3KQA8 63 aa20.21■□□□□ 0.83
UBXN6-206ENST00000590466 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
UBXN6-206ENST00000590466 TPP1O14773 563 aa20.2■□□□□ 0.82
UBXN6-206ENST00000590466 CLDN7O95471 211 aa20.2■□□□□ 0.82
UBXN6-206ENST00000590466 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
UBXN6-206ENST00000590466 SOD1P00441 154 aa20.2■□□□□ 0.82
UBXN6-206ENST00000590466 TSHRP16473 764 aa20.2■□□□□ 0.82
UBXN6-206ENST00000590466 ACP1P24666 158 aa20.2■□□□□ 0.82
UBXN6-206ENST00000590466 C1orf61Q13536 156 aa20.2■□□□□ 0.82
UBXN6-206ENST00000590466 PRRT3Q5FWE3 981 aa20.2■□□□□ 0.82
UBXN6-206ENST00000590466 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa20.2■□□□□ 0.82
UBXN6-206ENST00000590466 NLRP8Q86W28 1048 aa20.2■□□□□ 0.82
UBXN6-206ENST00000590466 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
UBXN6-206ENST00000590466 ZNF567Q8N184 647 aa20.2■□□□□ 0.82
UBXN6-206ENST00000590466 HTR3CQ8WXA8 447 aa20.2■□□□□ 0.82
UBXN6-206ENST00000590466 OR1E3Q8WZA6 343 aa20.2■□□□□ 0.82
UBXN6-206ENST00000590466 HES6Q96HZ4 224 aa20.2■□□□□ 0.82
UBXN6-206ENST00000590466 VAT1Q99536 393 aa20.2■□□□□ 0.82
UBXN6-206ENST00000590466 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
UBXN6-206ENST00000590466 DUSP23Q9BVJ7 150 aa20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.6 ms