RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587009.5

UBXN6-203, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 2

Gene UBXN6, Length 1,967 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-203ENST00000587009 FAM126BQ8IXS8 530 aa20.54■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 MGME1Q9BQP7 344 aa20.54■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 DNMT3LQ9UJW3 386 aa20.54■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 FIS1Q9Y3D6 152 aa20.54■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 TRAF6Q9Y4K3 522 aa20.54■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 CFLARO15519 480 aa20.53■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 CD1DP15813 335 aa20.53■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 ME2P23368 584 aa20.53■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 GATMP50440 423 aa20.53■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 GNA12Q03113 381 aa20.53■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 STX5Q13190 355 aa20.53■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 GALNT3Q14435 633 aa20.53■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 LPCAT4Q643R3 524 aa20.53■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 ZFP1Q6P2D0 407 aa20.53■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 PIM3Q86V86 326 aa20.53■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 SPNS2Q8IVW8 549 aa20.53■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.53■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 OR4L1Q8NH43 312 aa20.53■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 CEP295NLQ96MC4 621 aa20.53■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 TRIB3Q96RU7 358 aa20.53■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 TMEM175Q9BSA9 504 aa20.53■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa20.53■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 CATSPERZQ9NTU4 200 aa20.53■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 SEPT3Q9UH03 358 aa20.53■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 LRFN2Q9ULH4 789 aa20.53■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 UBDO15205 165 aa20.52■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 NBNO60934 754 aa20.52■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 KCNC1P48547 511 aa20.52■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 SLC11A2P49281 568 aa20.52■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 RPL26P61254 145 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 CEACAM7Q14002 265 aa20.52■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 FLOT2Q14254 428 aa20.52■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 OR52E8Q6IFG1 317 aa20.52■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 CFAP52Q8N1V2 620 aa20.52■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 ABHD8Q96I13 439 aa20.52■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 TTPALQ9BTX7 342 aa20.52■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 PACSIN3Q9UKS6 424 aa20.52■□□□□ 0.88
UBXN6-203ENST00000587009 A0A0D9SEW6 157 aa20.52■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 SLC4A1P02730 911 aa20.52■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 GALTP07902 379 aa20.52■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 ATF6P18850 670 aa20.52■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 SLC6A4P31645 630 aa20.52■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 CDH4P55283 916 aa20.52■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 HERVK_113P63132 956 aa20.52■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 TRIP10Q15642 601 aa20.52■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 UNC50Q53HI1 259 aa20.52■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 SFT2D3Q587I9 215 aa20.52■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa20.52■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 PQLC1Q8N2U9 271 aa20.52■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 OR13C4Q8NGS5 318 aa20.52■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 PTERQ96BW5 349 aa20.52■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 ASB2Q96Q27 587 aa20.52■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 PSKH2Q96QS6 385 aa20.52■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 ERVK-6Q9BXR3 956 aa20.52■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 HOXA2O43364 376 aa20.51■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 GPC4O75487 556 aa20.51■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 SUPT7LO94864 414 aa20.51■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 CRTAMO95727 393 aa20.51■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 PEX2P28328 305 aa20.51■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 DPP6P42658 865 aa20.51■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 PTPRCAPQ14761 206 aa20.51■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 LRRC36Q1X8D7 754 aa20.51■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 TYSND1Q2T9J0 566 aa20.51■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 IL31Q6EBC2 164 aa20.51■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 RHEBL1Q8TAI7 183 aa20.51■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 DLG3Q92796 817 aa20.51■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 NPAS2Q99743 824 aa20.51■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 EBF3Q9H4W6 596 aa20.51■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 LYNP07948 512 aa20.5■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 STC1P52823 247 aa20.5■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 PKNOX1P55347 436 aa20.5■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 BFSP2Q13515 415 aa20.5■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 PTK2BQ14289 1009 aa20.5■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 SEMA3AQ14563 771 aa20.5■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 GPNMBQ14956 572 aa20.5■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 TRIM60Q495X7 471 aa20.5■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 GK5Q6ZS86 529 aa20.5■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa20.5■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 NPAS4Q8IUM7 802 aa20.5■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 TMEM126BQ8IUX1 230 aa20.5■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 PDZD8Q8NEN9 1154 aa20.5■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 OR7D4Q8NG98 312 aa20.5■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 OR52K2Q8NGK3 314 aa20.5■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 SH3RF2Q8TEC5 729 aa20.5■□□□□ 0.87
UBXN6-203ENST00000587009 OVCA2Q8WZ82 227 aa20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.5 ms