RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 HIST1H2ACQ93077 130 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 UBE2QL1A1L167 161 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 OR10H3O60404 316 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 STARP49675 285 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 NOMO1Q15155 1222 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 SLC44A1Q8WWI5 657 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 COMMD9Q9P000 198 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 DPYSQ14117 519 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 PAGE2Q7Z2X7 111 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 HELQQ8TDG4 1101 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 BRD9Q9H8M2 597 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 ITGB5P18084 799 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 BBIP1A8MTZ0 92 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 S100A6P06703 90 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 EVX2Q03828 476 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 IQCKQ8N0W5 287 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 COX4I2Q96KJ9 171 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 IKZF4Q9H2S9 585 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 A0A0J9YYE9 177 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 TIPRLO75663 272 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 CDH13P55290 713 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 RTP1P59025 263 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 SEMA5AQ13591 1074 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 POTEHQ6S545 545 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 LHX5Q9H2C1 402 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 HAT1O14929 419 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 GRM5P41594 1212 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 EEF1DP3Q658K8 133 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 PQLC1Q8N2U9 271 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 C17orf50Q8WW18 174 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 SLC25A52Q3SY17 297 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 SMYD1Q8NB12 490 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 FNDC11Q9BVV2 318 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC162PA2VCL2 907 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 TGDSO95455 350 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 HDCP19113 662 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 CXCL17Q6UXB2 119 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 TBC1D3BA6NDS4 549 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 TULP2O00295 520 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 FGF1P05230 155 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 HNF4AP41235 474 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 WNT3AP56704 352 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 ZFP69Q49AA0 526 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 FAM151BQ6UXP7 276 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 MROH2AA6NES4 1674 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 CCNKO75909 580 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 AIF1P55008 147 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 DLG2Q15700 870 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 FAM35AQ86V20 835 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 XYLT1Q86Y38 959 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 FAM13CQ8NE31 585 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 RRAGCQ9HB90 399 aa21.35■■□□□ 1.01
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PTPRM-211ENST00000580170 RCVRNP35243 200 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 BHLHB9Q6PI77 547 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 DEF8Q6ZN54 512 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM139Q8IV31 216 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 TOP6BLQ8N6T0 577 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 B3GALT6Q96L58 329 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 RHOJQ9H4E5 214 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF221Q9UK13 617 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 ARPC4P59998 168 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 NOMO2Q5JPE7 1267 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 ANXA8L1Q5VT79 327 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC28BQ9BUN5 200 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 AGLP35573 1532 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 NRP2O60462 931 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 RPL9P32969 192 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 C12orf56Q8IXR9 622 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 KLHL5Q96PQ7 755 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 IFNA16P05015 189 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 DGKZQ13574 1117 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 SLC1A5Q15758 541 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 RASAL3Q86YV0 1011 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 GPSM3Q9Y4H4 160 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 SUV39H1O43463 412 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 SP100P23497 879 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 KLF10Q13118 480 aa21.34■■□□□ 1.01
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