RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544432.5

VAMP1-208, Transcript of vesicle associated membrane protein 1, human

TSL 3

Gene VAMP1, Length 759 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VAMP1-208	ENST00000544432	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		13.93	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		13.93	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		13.93	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	HID1	Q8IV36	788 aa		13.93	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	NUS1	Q96E22	293 aa		13.93	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	DTD2	Q96FN9	168 aa		13.93	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	LYSMD1	Q96S90	227 aa		13.93	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	LGMN	Q99538	433 aa		13.93	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	CLPB	Q9H078	707 aa		13.93	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	WDR26	Q9H7D7	661 aa		13.93	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	KL	Q9UEF7	1012 aa		13.93	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		13.93	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		13.93	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432		A0A0J9YYE9	177 aa		13.92	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	FAM149A	A5PLN7	773 aa		13.92	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		13.92	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	YY2	O15391	372 aa		13.92	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	OPA1	O60313	960 aa		13.92	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	NDUFA10	O95299	355 aa		13.92	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	TNF	P01375	233 aa		13.92	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	TRBC1	P01850	177 aa		13.92	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	CTSE	P14091	401 aa		13.92	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	13.92	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	C1orf61	Q13536	156 aa		13.92	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	ARHGEF7	Q14155	803 aa		13.92	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	NR0B2	Q15466	257 aa		13.92	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	SLC14A2	Q15849	920 aa		13.92	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		13.92	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		13.92	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		13.92	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		13.92	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	PROSER1	Q86XN7	944 aa		13.92	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	GKN2	Q86XP6	184 aa		13.92	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		13.92	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	RFX6	Q8HWS3	928 aa		13.92	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		13.92	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		13.92	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	CNTD1	Q8N815	330 aa		13.92	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		13.92	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		13.92	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	13.92	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	TEX101	Q9BY14	249 aa		13.92	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	CHKB	Q9Y259	395 aa		13.92	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	ACACA	Q13085	2346 aa		13.92	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	APC2	O95996	2303 aa		13.91	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	TMEM202	A6NGA9	273 aa		13.91	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	KCNK1	O00180	336 aa		13.91	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	TAF4	O00268	1085 aa		13.91	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	13.91	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	MT-CO3	P00414	261 aa		13.91	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	MMP2	P08253	660 aa		13.91	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	ETV3	P41162	512 aa		13.91	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	EPHB1	P54762	984 aa		13.91	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	SKOR1	P84550	965 aa		13.91	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	PTS	Q03393	145 aa		13.91	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	AP1B1	Q10567	949 aa		13.91	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		13.91	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432		Q6ZVL8	140 aa		13.91	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		13.91	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		13.91	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		13.91	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	IFI44	Q8TCB0	444 aa		13.91	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		13.91	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		13.91	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		13.91	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		13.91	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	FGF22	Q9HCT0	170 aa		13.91	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		13.91	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	13.91	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		13.91	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	CHD6	Q8TD26	2715 aa		13.91	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		13.9	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	CAPN8	A6NHC0	703 aa		13.9	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		13.9	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	PYGL	P06737	847 aa		13.9	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	MYF5	P13349	255 aa		13.9	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	TNNT1	P13805	278 aa		13.9	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	CTPS1	P17812	591 aa		13.9	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	TGM2	P21980	687 aa		13.9	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	STC1	P52823	247 aa		13.9	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	ZBTB17	Q13105	803 aa		13.9	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	RTP5	Q14D33	572 aa		13.9	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	PTPRR	Q15256	657 aa		13.9	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	TEX44	Q53QW1	395 aa		13.9	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	LRRC66	Q68CR7	880 aa		13.9	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	NPNT	Q6UXI9	565 aa		13.9	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		13.9	□□□□□ -0.18
VAMP1-208	ENST00000544432	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		13.9	□□□□□ -0.18

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