RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 MSRAQ9UJ68 235 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 B2RBV5 119 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 DIAPH2O60879 1101 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 AOC1P19801 751 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 ARSDP51689 593 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 ARF5P84085 180 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 ACVR1Q04771 509 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM83EQ2M2I3 478 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF789Q5FWF6 425 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 ICE2Q659A1 982 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 TPGS1Q6ZTW0 290 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 TMPRSS6Q8IU80 811 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 ITFG1Q8TB96 612 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 BRSK1Q8TDC3 778 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 NSMCE3Q96MG7 304 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 NDNQ99608 321 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 MUC3BQ9H195 1237 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 SNAP91O60641 907 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 ZMPSTE24O75844 475 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 NDST3O95803 873 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 ARHGAP8P85298 464 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 DLG1Q12959 904 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 USP4Q13107 963 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 GALNT3Q14435 633 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 TMC5Q6UXY8 1006 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 ARHGAP24Q8N264 748 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 DDI1Q8WTU0 396 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 FEM1AQ9BSK4 669 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 LMAN2LQ9H0V9 348 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 COG4Q9H9E3 785 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 TDP1Q9NUW8 608 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 RAP2CQ9Y3L5 183 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 KCTD3Q9Y597 815 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 CBX4O00257 560 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 DLX3O60479 287 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 CSKP41240 450 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 RGRP47804 291 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 HK2P52789 917 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 NAGLUP54802 743 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 KDSRQ06136 332 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 RAB30Q15771 203 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 EPGNQ6UW88 154 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 SPATA6LQ8N4H0 392 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 HEXDCQ8WVB3 486 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 OLFM1Q99784 485 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 DPP7Q9UHL4 492 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 RIMKLBQ9ULI2 386 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 VWA7Q9Y334 891 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 PAPLNO95428 1278 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 S1PR4O95977 384 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 EZRP15311 586 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 CES1P23141 567 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 CPA2P48052 419 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 CYTH1Q15438 398 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 HECTD2Q5U5R9 776 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 AGAP9Q5VTM2 703 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF783Q6ZMS7 281 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 TBATAQ96M53 351 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 NUDCD1Q96RS6 583 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIB3Q96RU7 358 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC28A3Q9HAS3 691 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 IGSF5Q9NSI5 407 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 ARL5AQ9Y689 179 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 CCL22O00626 93 aa20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 GLP2RO95838 553 aa20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 PRKAA1Q13131 559 aa20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 E2F5Q15329 346 aa20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF77Q15935 545 aa20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 MPPE1Q53F39 396 aa20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 KLC3Q6P597 504 aa20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 GPAMQ9HCL2 828 aa20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 L3MBTL1Q9Y468 752 aa20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 SOBPA7XYQ1 873 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 INSIG1O15503 277 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 RPP40O75818 363 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 CHRNGP07510 517 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 RPL14P50914 215 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 SCNN1BP51168 640 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 CDH18Q13634 790 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 CSHL1Q14406 222 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 MRNIPQ6NTE8 343 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 LINGO4Q6UY18 593 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 MFN1Q8IWA4 741 aa20.27■□□□□ 0.84
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