RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531129.5

GPATCH4-215, Transcript of G-patch domain containing 4, human

TSL 5

Gene GPATCH4, Length 532 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPATCH4-215	ENST00000531129	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	SP110	Q9HB58	689 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	LGALS16	A8MUM7	142 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	ARHGAP6	O43182	974 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	ECEL1	O95672	775 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	CPNE6	O95741	557 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	ITGB2	P05107	769 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	MPST	P25325	297 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	CD1C	P29017	333 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	HTR7	P34969	479 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	ETV3	P41162	512 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	GNPDA1	P46926	289 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	IL10RB	Q08334	325 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	CLCA4	Q14CN2	919 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	CNGA3	Q16281	694 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	MAP9	Q49MG5	647 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	PIM3	Q86V86	326 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	PGBD5	Q8N414	524 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	TMEM159	Q96B96	161 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	SYT11	Q9BT88	431 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	STARD5	Q9NSY2	213 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	IL17B	Q9UHF5	180 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129		A0A1W2PQC6	194 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	PPM1D	O15297	605 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	SUV39H1	O43463	412 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	TNFAIP3	P21580	790 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	LHCGR	P22888	699 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	MIP	P30301	263 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	CSRP3	P50461	194 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129		Q6ZVL8	140 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	NUS1	Q96E22	293 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	SMIM14	Q96QK8	99 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	PSKH2	Q96QS6	385 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	TEX101	Q9BY14	249 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	NOD2	Q9HC29	1040 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	PARVA	Q9NVD7	372 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	DONSON	Q9NYP3	566 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	SUFU	Q9UMX1	484 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	PEX11B	O96011	259 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	CP	P00450	1065 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	TCF4	P15884	667 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	FER	P16591	822 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	CR2	P20023	1033 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	AMPD1	P23109	780 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	VIPR1	P32241	457 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	MAX	P61244	160 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	AP1S1	P61966	158 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	CTBS	Q01459	385 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	11.61	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	TRAF2	Q12933	501 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	DPYS	Q14117	519 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
GPATCH4-215	ENST00000531129	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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