RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 OR14A16Q8NHC5 309 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 MIB2Q96AX9 1013 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 MMP25Q9NPA2 562 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 WNT16Q9UBV4 365 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 MYO6Q9UM54 1294 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 ERVK-11Q9UQG0 969 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 PAM16Q9Y3D7 125 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 SNAP23O00161 211 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 HCRTR2O43614 444 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 GAGE7O76087 117 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 CH25HO95992 272 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 CYC1P08574 325 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 GAGE12FP0CL80 117 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 GAGE12GP0CL81 117 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 GAGE12IP0CL82 117 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 HOXD13P35453 343 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 THBS3P49746 956 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 F2RL1P55085 397 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 KRTAP10-11P60412 298 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRAMEP78395 509 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 ARF1P84077 181 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 ECT2LQ008S8 904 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 LTBQ06643 244 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 GRIK2Q13002 908 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 GAGE1Q13065 139 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 GAGE4Q13068 117 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 ADIPOQQ15848 244 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 AMZ1Q400G9 498 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 MMEL1Q495T6 779 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDONQ4KMG0 1287 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 EFHC1Q5JVL4 640 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 GGNBP1Q5YKI7 109 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 JADE1Q6IE81 842 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 KLHL35Q6PF15 583 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 SARM1Q6SZW1 724 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 PQLC2Q6ZP29 291 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 FOXRED2Q8IWF2 684 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 PDILTQ8N807 584 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 ELP5Q8TE02 316 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 POMGNT1Q8WZA1 660 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 IGSF8Q969P0 613 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 ARHGEF26Q96DR7 871 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 LYZL4Q96KX0 146 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 CMTM3Q96MX0 182 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 ACOX2Q99424 681 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM47Q9BQJ4 181 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 HAUS8Q9BT25 410 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 WACQ9BTA9 647 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 IL25Q9H293 177 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 GHITMQ9H3K2 345 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 NDST4Q9H3R1 872 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 GPR108Q9NPR9 543 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 KRT84Q9NSB2 600 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 RCOR1Q9UKL0 485 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDC14AQ9UNH5 594 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 A8MZ25 164 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 MYO1GB0I1T2 1018 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 KCNJ13O60928 360 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 NDUFS7O75251 213 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 DAB1O75553 588 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 JRKO75564 520 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 TIPRLO75663 272 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC25A12O75746 678 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 SERPINI2O75830 405 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 NKX2-2O95096 273 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 SNHG28P0DPA3 235 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 G6PDP11413 515 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 SRCP12931 536 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 IL7RP16871 459 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 STX2P32856 288 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 DRG2P55039 364 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms