RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 SLC6A17Q9H1V8 727 aa22.06■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 MFSD1Q9H3U5 465 aa22.06■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 VIPAS39Q9H9C1 493 aa22.06■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 RIMKLBQ9ULI2 386 aa22.06■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 CKAP5Q14008 2032 aa22.06■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa22.06■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 CCL22O00626 93 aa22.06■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 PIAS1O75925 651 aa22.06■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 ERVK-10P10266 1014 aa22.06■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 HADHAP40939 763 aa22.06■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 SUOXP51687 545 aa22.06■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 KLHL38Q2WGJ6 581 aa22.06■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa22.06■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 TJAP1Q5JTD0 557 aa22.06■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 KCNMB4Q86W47 210 aa22.06■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 OR13J1Q8NGT2 312 aa22.06■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 CDKL2Q92772 493 aa22.06■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 TBATAQ96M53 351 aa22.06■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 ACBD3Q9H3P7 528 aa22.06■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 ACSS3Q9H6R3 686 aa22.06■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 MOCS1Q9NZB8 636 aa22.06■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 MYLKQ15746 1914 aa22.05■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 A0A1W2PP55 124 aa22.05■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa22.05■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 GOLGA8KD6RF30 607 aa22.05■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 GOLGA8TH3BQL2 631 aa22.05■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 RPP40O75818 363 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 ALDH1A2O94788 518 aa22.05■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF30P17039 623 aa22.05■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 MGAT5Q09328 741 aa22.05■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 CDKN3Q16667 212 aa22.05■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 PDPK2PQ6A1A2 396 aa22.05■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 CYS1Q717R9 158 aa22.05■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 RASSF3Q86WH2 238 aa22.05■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 AADATQ8N5Z0 425 aa22.05■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 RAB7BQ96AH8 199 aa22.05■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 FBXL12Q9NXK8 326 aa22.05■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 ITM2BQ9Y287 266 aa22.05■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 SMIM23A6NLE4 172 aa22.04■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 GOLGA8CPA6NN73 597 aa22.04■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 MAP2K7O14733 419 aa22.04■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 SASH3O75995 380 aa22.04■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 IVLP07476 585 aa22.04■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 LHCGRP22888 699 aa22.04■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 DRD3P35462 400 aa22.04■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 ARSDP51689 593 aa22.04■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 DGKEP52429 567 aa22.04■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 FZD5Q13467 585 aa22.04■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa22.04■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 LRIG3Q6UXM1 1119 aa22.04■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 DPPA4Q7L190 304 aa22.04■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 SYT13Q7L8C5 426 aa22.04■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 PGBD3Q8N328 593 aa22.04■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 OTUD6BQ8N6M0 293 aa22.04■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 PJA1Q8NG27 643 aa22.04■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 EID2BQ96D98 161 aa22.04■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa22.04■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 IL17CQ9P0M4 197 aa22.04■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 ZFATQ9P243 1243 aa22.04■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 SCML1Q9UN30 329 aa22.04■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 SIT1Q9Y3P8 196 aa22.04■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 TLDC2A0PJX2 215 aa22.03■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 ATP8B1O43520 1251 aa22.03■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 ELFN1P0C7U0 828 aa22.03■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 MMP12P39900 470 aa22.03■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 PTSQ03393 145 aa22.03■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 CEP85LQ5SZL2 805 aa22.03■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 PPM1NQ8N819 430 aa22.03■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 HMGB4Q8WW32 186 aa22.03■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 MRGPRX1Q96LB2 322 aa22.03■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 CD248Q9HCU0 757 aa22.03■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa22.03■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 NFS1Q9Y697 457 aa22.03■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 IKBKGQ9Y6K9 419 aa22.03■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 NDUFV2P19404 249 aa22.03■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 ACVR1Q04771 509 aa22.03■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 ZBTB16Q05516 673 aa22.03■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa22.03■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 OSBPL6Q9BZF3 934 aa22.03■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 PKD2L2Q9NZM6 624 aa22.03■■□□□ 1.12
PSPC1-204ENST00000492741 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms