RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481848.6

SOGA3-207, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS P5 TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 11,464 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-207ENST00000481848 PCDHA6Q9UN73 950 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 FADS2P1A8MWK0 482 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 ITGB6P18564 788 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 AUHQ13825 339 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 PON2Q15165 354 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 DDB1Q16531 1140 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 TEX19Q8NA77 164 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 DNAJB3Q8WWF6 145 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 KIF12Q96FN5 646 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 CRYL1Q9Y2S2 319 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 CYP3A4P08684 503 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 CUL2Q13617 745 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 LNX2Q8N448 690 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 MED30Q96HR3 178 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 C7orf26Q96N11 449 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 COPS4Q9BT78 406 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 GADD45AP24522 165 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 GIT2Q14161 759 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 TPRG1LQ5T0D9 272 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 OR5B12Q96R08 314 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 RIIAD1A6NNX1 92 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 C3orf33Q6P1S2 294 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 CD300LFQ8TDQ1 290 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 NR2E1Q9Y466 385 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 SULT1C2O00338 296 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 ADAM10O14672 748 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 IFNA21P01568 189 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 FDX1P10109 184 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 LHCGRP22888 699 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF81P51508 661 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 LRRN1Q6UXK5 716 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 KDELC2Q7Z4H8 507 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 GPSM1Q86YR5 675 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 PDZD9Q8IXQ8 264 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 METTL4Q8N3J2 472 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 ST8SIA6P61647 398 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 MPP1Q00013 466 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 NXPE2Q96DL1 559 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 TMEM121Q9BTD3 319 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 TPK1Q9H3S4 243 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 C14orf105Q9NVL8 296 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 PLA2R1Q13018 1463 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 AVILO75366 819 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 IFNA1P01562 189 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 IQSEC1Q6DN90 963 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 GCNT7Q6ZNI0 430 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 SPATA19Q7Z5L4 167 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 SPATA22Q8NHS9 363 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 AP4E1Q9UPM8 1137 aa12.5□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 H0Y858 1186 aa12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 GRID2O43424 1007 aa12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 SV2CQ496J9 727 aa12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 SLC44A3Q8N4M1 653 aa12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 TRAPPC13A5PLN9 417 aa12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 EDF1O60869 148 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 LDLRAP1Q5SW96 308 aa12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 MILR1Q7Z6M3 343 aa12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 CYP4B1P13584 511 aa12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 HALP42357 657 aa12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 TSPAN5P62079 268 aa12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 ING5Q8WYH8 240 aa12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 ACOX3O15254 700 aa12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 C11orf96Q7Z7L8 435 aa12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 TOMM5Q8N4H5 51 aa12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 PHOX2BQ99453 314 aa12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 ANXA2P2A6NMY6 339 aa12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 TPP1O14773 563 aa12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 SLC22A3O75751 556 aa12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 ABCA11PQ4W5N1 156 aa12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF416Q9BWM5 594 aa12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 OPTCQ9UBM4 332 aa12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 NME7Q9Y5B8 376 aa12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 SCAMP1O15126 338 aa12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 GRK1Q15835 563 aa12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 UBE2SQ16763 222 aa12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 DPP9Q86TI2 863 aa12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 TRPS1Q9UHF7 1281 aa12.49□□□□□ -0.41
SOGA3-207ENST00000481848 FKBP7Q9Y680 259 aa12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms