RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	17.77	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	OR1A2	Q9Y585	309 aa		17.77	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		17.76	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		17.76	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	FLRT2	O43155	660 aa		17.76	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	PCDHGA12	O60330	932 aa		17.76	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	SLC4A1	P02730	911 aa		17.76	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	ETV3	P41162	512 aa		17.76	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	RXRG	P48443	463 aa		17.76	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	YPEL5	P62699	121 aa		17.76	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	17.76	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	AGER	Q15109	404 aa		17.76	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	SHB	Q15464	509 aa		17.76	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	INAVA	Q3KP66	663 aa		17.76	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		17.76	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		17.76	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		17.76	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902		Q6ZVL8	140 aa		17.76	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	PIP4P1	Q86T03	277 aa		17.76	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	17.76	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		17.76	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	IPMK	Q8NFU5	416 aa		17.76	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	COQ10A	Q96MF6	247 aa		17.76	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		17.76	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	FCRL5	Q96RD9	977 aa		17.76	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	APOO	Q9BUR5	198 aa		17.76	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		17.76	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	CARD9	Q9H257	536 aa		17.76	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	CD84	Q9UIB8	345 aa		17.76	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	PSMD11	O00231	422 aa		17.75	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	TOR1B	O14657	336 aa		17.75	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	17.75	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	CLDN7	O95471	211 aa		17.75	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	NDST3	O95803	873 aa		17.75	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	PIRT	P0C851	137 aa		17.75	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	CEACAM1	P13688	526 aa		17.75	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	ZNF30	P17039	623 aa		17.75	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	GM2A	P17900	193 aa		17.75	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	HTR1B	P28222	390 aa		17.75	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	17.75	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	CXCR5	P32302	372 aa		17.75	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	GRK6	P43250	576 aa		17.75	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	WNT3A	P56704	352 aa		17.75	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	MTM1	Q13496	603 aa		17.75	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	FZD2	Q14332	565 aa		17.75	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	PRPSAP1	Q14558	356 aa		17.75	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		17.75	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		17.75	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	PARG	Q86W56	976 aa		17.75	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		17.75	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		17.75	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		17.75	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		17.75	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	DTD2	Q96FN9	168 aa		17.75	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		17.75	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	TLR10	Q9BXR5	811 aa		17.75	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	GBA3	Q9H227	469 aa		17.75	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		17.75	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		17.75	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	17.75	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	17.75	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902		H3BM21	787 aa		17.74	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	ENC1	O14682	589 aa		17.74	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	CEP104	O60308	925 aa		17.74	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	ANXA9	O76027	345 aa		17.74	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	JUND	P17535	347 aa		17.74	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	SHC2	P98077	582 aa		17.74	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	PTS	Q03393	145 aa		17.74	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	SNX1	Q13596	522 aa		17.74	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	SLC14A2	Q15849	920 aa		17.74	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	FAXC	Q5TGI0	409 aa		17.74	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		17.74	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	PNCK	Q6P2M8	343 aa		17.74	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		17.74	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		17.74	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		17.74	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		17.74	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	EID2	Q8N6I1	236 aa		17.74	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	SAP25	Q8TEE9	199 aa		17.74	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	TADA1	Q96BN2	335 aa		17.74	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	17.74	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	TRIB3	Q96RU7	358 aa		17.74	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		17.74	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		17.74	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	USP29	Q9HBJ7	922 aa		17.74	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	GPR27	Q9NS67	375 aa		17.74	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		17.74	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		17.74	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		17.73	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902		K7ESM1	405 aa		17.73	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	17.73	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	KIF5C	O60282	957 aa		17.73	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	C1S	P09871	688 aa		17.73	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	17.73	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	PSMB4	P28070	264 aa		17.73	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	STC1	P52823	247 aa		17.73	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	GEM	P55040	296 aa		17.73	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	17.73	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	17.73	■□□□□ 0.43
USP19-210	ENST00000465902	MPP3	Q13368	585 aa		17.73	■□□□□ 0.43

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