RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462970.5

PSMD4-208, Transcript of proteasome 26S subunit, non-ATPase 4, human

TSL 5

Gene PSMD4, Length 900 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMD4-208	ENST00000462970	CLDN7	O95471	211 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	TRBC1	P01850	177 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	ZNF883	P0CG24	379 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	LHCGR	P22888	699 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	CXCR5	P32302	372 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	GRK6	P43250	576 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	WNT3A	P56704	352 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	CDK18	Q07002	472 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	SNX1	Q13596	522 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	PTK2B	Q14289	1009 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	FZD2	Q14332	565 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	SHB	Q15464	509 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	QPCT	Q16769	361 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	FAXC	Q5TGI0	409 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	PARG	Q86W56	976 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	HID1	Q8IV36	788 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	EID2	Q8N6I1	236 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	IPMK	Q8NFU5	416 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	COQ10A	Q96MF6	247 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	VAT1	Q99536	393 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	APOO	Q9BUR5	198 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	FICD	Q9BVA6	458 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	CFAP69	A5D8W1	941 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970		H3BM21	787 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970		K7ESM1	405 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	ENC1	O14682	589 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	PCDHGA12	O60330	932 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	FZD6	O60353	706 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	NDST3	O95803	873 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	PRL	P01236	227 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	CEACAM1	P13688	526 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	JUND	P17535	347 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	PSMB4	P28070	264 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	HTR1B	P28222	390 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	PFN3	P60673	137 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	MTM1	Q13496	603 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	PRPSAP1	Q14558	356 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	HS1BP3	Q53T59	392 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	DOK6	Q6PKX4	331 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	PIP4P1	Q86T03	277 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	RBFA	Q8N0V3	343 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	LMX1A	Q8TE12	382 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	AP2M1	Q96CW1	435 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	DTD2	Q96FN9	168 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	APOL2	Q9BQE5	337 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	GBA3	Q9H227	469 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	WDR26	Q9H7D7	661 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	KL	Q9UEF7	1012 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	LRP4	O75096	1905 aa		9.6	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		9.6	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	INPP4B	O15327	924 aa		9.6	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	PIAS2	O75928	621 aa		9.6	□□□□□ -0.87
PSMD4-208	ENST00000462970	ANXA9	O76027	345 aa		9.6	□□□□□ -0.87

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