RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-208ENST00000462335 CCDC110Q8TBZ0 833 aa9.58□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 C1orf54Q8WWF1 131 aa9.58□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 GLMNQ92990 594 aa9.58□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 CENPTQ96BT3 561 aa9.58□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 PDLIM2Q96JY6 352 aa9.58□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 SPATA13Q96N96 652 aa9.58□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 TMEM121Q9BTD3 319 aa9.58□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 APOOQ9BUR5 198 aa9.58□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 GBA3Q9H227 469 aa9.58□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 WDR26Q9H7D7 661 aa9.58□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 IL21RQ9HBE5 538 aa9.58□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa9.58□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 HACD3Q9P035 362 aa9.58□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 SHOC2Q9UQ13 582 aa9.58□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa9.58□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 PKP3Q9Y446 797 aa9.58□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa9.58□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 PLXNA2O75051 1894 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 MYO15AQ9UKN7 3530 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 DOCK9Q9BZ29 2069 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 A0A1B0GTQ1 180 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 RGSL1A5PLK6 1076 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 C5orf60A6NFR6 353 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 C2orf81A6NN90 581 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 SH3BP5O60239 455 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 CLDN7O95471 211 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 TNFP01375 233 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 EPOP01588 193 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 TSHRP16473 764 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 JUNDP17535 347 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 HLA-DPA1P20036 260 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 ETV3P41162 512 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 BIRC2Q13490 618 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 FGL2Q14314 439 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 SLC14A2Q15849 920 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 CNGA3Q16281 694 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 QPCTQ16769 361 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 PARP6Q2NL67 630 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 ZNF542PQ5EBM4 170 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 PPM1JQ5JR12 505 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 PNCKQ6P2M8 343 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 CRTC1Q6UUV9 634 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 C4orf22Q6V702 233 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 GCNT7Q6ZNI0 430 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 Q6ZVL8 140 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 TSPAN33Q86UF1 283 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 HID1Q8IV36 788 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 NAXDQ8IW45 347 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 SLC35F6Q8N357 371 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 DNAAF3Q8N9W5 541 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 DEFB124Q8NES8 71 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 BMFQ96LC9 184 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 WDR92Q96MX6 357 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 ORAI3Q9BRQ5 295 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 FICDQ9BVA6 458 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 SPATA16Q9BXB7 569 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 KCNF1Q9H3M0 494 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 FAM83DQ9H4H8 585 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 TRABDQ9H4I3 376 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 MAGEE1Q9HCI5 957 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 SPASTQ9UBP0 616 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 KLQ9UEF7 1012 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 FTSJ1Q9UET6 329 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 CD84Q9UIB8 345 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 PPIL1Q9Y3C6 166 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 OR1A2Q9Y585 309 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa9.57□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 KNL1Q8NG31 2342 aa9.56□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa9.56□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa9.56□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa9.56□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 CTAGE9A4FU28 777 aa9.56□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 FFAR2O15552 330 aa9.56□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 SPINT1O43278 529 aa9.56□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 LIASO43766 372 aa9.56□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 PCDHGA12O60330 932 aa9.56□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 FZD6O60353 706 aa9.56□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 SDC3O75056 442 aa9.56□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 GCATO75600 419 aa9.56□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 RASGRP1O95267 797 aa9.56□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 CRTAMO95727 393 aa9.56□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 FGF1P05230 155 aa9.56□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 ANXA6P08133 673 aa9.56□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 MMP2P08253 660 aa9.56□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 PIRTP0C851 137 aa9.56□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 CEACAM1P13688 526 aa9.56□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 TCP1P17987 556 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PKP4-208ENST00000462335 PSMB4P28070 264 aa9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms