RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 OR13C4Q8NGS5 318 aa20.49■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 C3orf30Q96M34 536 aa20.49■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa20.49■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 INPPL1O15357 1258 aa20.49■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 AP1G1O43747 822 aa20.49■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 CD1DP15813 335 aa20.49■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 FDXRP22570 491 aa20.49■□□□□ 0.87
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IMP4-208ENST00000460766 TAF10Q12962 218 aa20.49■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.876e-9■■■□□ 18.1
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IMP4-208ENST00000460766 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 MYEOVQ96EZ4 313 aa20.49■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 B3GALT6Q96L58 329 aa20.49■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 AK5Q9Y6K8 562 aa20.49■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 CCDC162PA2VCL2 907 aa20.48■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 NRP2O60462 931 aa20.48■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
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IMP4-208ENST00000460766 PSMD8P48556 350 aa20.48■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 SH3BP2P78314 561 aa20.48■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 GK3PQ14409 553 aa20.48■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 ZFAND2BQ8WV99 257 aa20.48■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 LPGAT1Q92604 370 aa20.48■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 EME1Q96AY2 570 aa20.48■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa20.48■□□□□ 0.87
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IMP4-208ENST00000460766 AP4S1Q9Y587 144 aa20.48■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 TRIM24O15164 1050 aa20.48■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 ETS2P15036 469 aa20.48■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 NME5P56597 212 aa20.48■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 SEMA3AQ14563 771 aa20.48■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 PFKFB4Q16877 469 aa20.48■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 KIF19Q2TAC6 998 aa20.48■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 CYP2R1Q6VVX0 501 aa20.48■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 SLC24A5Q71RS6 500 aa20.48■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 SH3GL3Q99963 347 aa20.48■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 SLC39A3Q9BRY0 314 aa20.48■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 CROTQ9UKG9 612 aa20.48■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 SARDHQ9UL12 918 aa20.48■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 LRRC14BA6NHZ5 514 aa20.47■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 DRGXA6NNA5 263 aa20.47■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 UBXN8O00124 270 aa20.47■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 PPP6CO00743 305 aa20.47■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 SRP72O76094 671 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 CSPG5O95196 566 aa20.47■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 PENKP01210 267 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 FGF1P05230 155 aa20.47■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 HLA-DPA1P20036 260 aa20.47■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 CDKL1Q00532 357 aa20.47■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 NFKB2Q00653 900 aa20.47■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 TNK2Q07912 1038 aa20.47■□□□□ 0.87
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IMP4-208ENST00000460766 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 MID1IP1Q9NPA3 183 aa20.47■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa20.47■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 MIA3Q5JRA6 1907 aa20.47■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 RPP40O75818 363 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 EOMESO95936 686 aa20.46■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 SMIM18P0DKX4 95 aa20.46■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 OR4D1Q15615 310 aa20.46■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 MGAT5BQ3V5L5 792 aa20.46■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 FAM26DQ5JW98 314 aa20.46■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 CFAP52Q8N1V2 620 aa20.46■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 FEM1CQ96JP0 617 aa20.46■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 AKTIPQ9H8T0 292 aa20.46■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 CATSPERZQ9NTU4 200 aa20.46■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa20.46■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa20.46■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 PRAMEF11O60813 436 aa20.46■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 C8BP07358 591 aa20.46■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 HSPA13P48723 471 aa20.46■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 FCGRTP55899 365 aa20.46■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 RHDQ02161 417 aa20.46■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 ACVR1Q04771 509 aa20.46■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 NRF1Q16656 503 aa20.46■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 UGT3A2Q3SY77 523 aa20.46■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 FAM171A1Q5VUB5 890 aa20.46■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 OR4L1Q8NH43 312 aa20.46■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 BRSK1Q8TDC3 778 aa20.46■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 LZTS1Q9Y250 596 aa20.46■□□□□ 0.87
IMP4-208ENST00000460766 H3BMM5 538 aa20.45■□□□□ 0.86
IMP4-208ENST00000460766 PRSS56P0CW18 603 aa20.45■□□□□ 0.86
IMP4-208ENST00000460766 MAGEA11P43364 429 aa20.45■□□□□ 0.86
IMP4-208ENST00000460766 EP400NLQ6ZTU2 488 aa20.45■□□□□ 0.86
IMP4-208ENST00000460766 LRTOMTQ8WZ04 291 aa20.45■□□□□ 0.86
IMP4-208ENST00000460766 TOP1MTQ969P6 601 aa20.45■□□□□ 0.86
IMP4-208ENST00000460766 IL37Q9NZH6 218 aa20.45■□□□□ 0.86
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