RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415046.6

PTPRK-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-209ENST00000415046 TOMM40O96008 361 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 EDN1P05305 212 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 MYL1P05976 194 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 CTSAP10619 480 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 ACVR2AP27037 513 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 NMT1P30419 496 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 CCKARP32238 428 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 NAMPTP43490 491 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 PTENP60484 403 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 ASIC1P78348 528 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 GIT2Q14161 759 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 RAB30Q15771 203 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 LRIT3Q3SXY7 679 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 SYCP2LQ5T4T6 812 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 SFR1Q86XK3 245 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 CEP57L1Q8IYX8 460 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 MYCT1Q8N699 235 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 METTL25Q8N6Q8 603 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 PNPLA1Q8N8W4 532 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 TIFAQ96CG3 184 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 BICD1Q96G01 975 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 FTHL17Q9BXU8 183 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 C2orf40Q9H1Z8 148 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 BLZF1Q9H2G9 400 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 FAM83DQ9H4H8 585 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 SLC28A3Q9HAS3 691 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 CHST12Q9NRB3 414 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 RGS18Q9NS28 235 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 DACT1Q9NYF0 836 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 HEY2Q9UBP5 337 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 SQORQ9Y6N5 450 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 MYO16Q9Y6X6 1858 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 PTPRDP23468 1912 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 OBSL1O75147 1896 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 GOLGA6CA6NDK9 693 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 GOLGA6BA6NDN3 693 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 AQP7P3A6NL99 342 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 K7ERI5 159 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 CLIC1O00299 241 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 GOLGA6DP0CG33 693 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 STAG3L1P0CL83 205 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 CBSLP0DN79 551 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 CD19P15391 556 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 CMA1P23946 247 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 CTNNB1P35222 781 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 CBSP35520 551 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 SYKP43405 635 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 NDUFA8P51970 172 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 EFNA5P52803 228 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 ITGA8P53708 1063 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 OSTNP61366 133 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 RPS16P62249 146 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 DEUP1Q05D60 604 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 SLC14A1Q13336 389 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 SLC29A2Q14542 456 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 MFSD13AQ14CX5 517 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 CNGA2Q16280 664 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 MAPK6Q16659 721 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 ST3GAL2Q16842 350 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 CLLU1OSQ5K130 101 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 ADALQ6DHV7 355 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 NOTUMQ6P988 496 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 SLC24A5Q71RS6 500 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 HAUS6Q7Z4H7 955 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 ECHDC2Q86YB7 292 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 TCEAL8Q8IYN2 117 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 DEFB123Q8N688 67 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 IQUBQ8NA54 791 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 GDPD5Q8WTR4 605 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 ARNTL2Q8WYA1 636 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 TOP1MTQ969P6 601 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 DNAJC19Q96DA6 116 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 ZFYVE19Q96K21 471 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 MARK4Q96L34 752 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 RAD9AQ99638 391 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 TIPINQ9BVW5 301 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
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