RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 C4orf47A7E2U8 309 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 K7ESF4 209 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 SYN3O14994 580 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 TRAPPC3O43617 180 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 LIASO43766 372 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 B3GAT3O94766 335 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 POMCP01189 267 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 APOC2P02655 101 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 TCF4P15884 667 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PDGFRAP16234 1089 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 LMO2P25791 158 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 MIPP30301 263 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 RDXP35241 583 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CARSP49589 748 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 RGS7P49802 495 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 FAM193AP78312 1265 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 TSPY1Q01534 308 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ADIGQ0VDE8 80 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CALCOCO2Q13137 446 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 SQSTM1Q13501 440 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 TFDP2Q14188 446 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PDK2Q15119 407 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PPP1R7Q15435 360 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 DPYSL2Q16555 572 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 BOLA3Q53S33 107 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 MDH1BQ5I0G3 518 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 NOMO2Q5JPE7 1267 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CFAP58Q5T655 872 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ALS2CLQ60I27 953 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 AADACL2Q6P093 401 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 TTC27Q6P3X3 843 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 MFSD7Q6UXD7 560 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 C4orf50Q6ZRC1 276 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PIGZQ86VD9 579 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 MAP7D3Q8IWC1 876 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 RNF169Q8NCN4 708 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 FAM172AQ8WUF8 416 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 RXFP2Q8WXD0 754 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 IRGQQ8WZA9 623 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 MYLPFQ96A32 169 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 FAF2Q96CS3 445 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 SNF8Q96H20 258 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PCED1BQ96HM7 432 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CCDC114Q96M63 670 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 SLC2A13Q96QE2 648 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 KXD1Q9BQD3 176 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 TSPYL1Q9H0U9 437 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 LRRC4Q9HBW1 653 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PCDH9Q9HC56 1237 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CNGB3Q9NQW8 809 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 HEBP1Q9NRV9 189 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 TMEM51Q9NW97 253 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 RRN3Q9NYV6 651 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 EML5Q05BV3 1969 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 TRIP11Q15643 1979 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 COL4A2P08572 1712 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 MGAQ8IWI9 3026 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ATMQ13315 3056 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 TULP2O00295 520 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 MCF2LO15068 1137 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 TEX28O15482 410 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 DAPK3O43293 454 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 HCRTO43612 131 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 OPA1O60313 960 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PPFIA2O75334 1257 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ENDOD1O94919 500 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 EPN2O95208 641 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 GALTP07902 379 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PDGFRBP09619 1106 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 TGM2P21980 687 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 IL1R2P27930 398 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 OAS2P29728 719 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 MATKP42679 507 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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