RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401029.3

CAPNS1P1-201, Transcript of calpain small subunit 1 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene CAPNS1P1, Length 633 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CLDN11O75508 207 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 RPP40O75818 363 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 VNN2O95498 520 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 BAG2O95816 211 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 GALTP07902 379 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SERPINF2P08697 491 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CD1DP15813 335 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SAT1P21673 171 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 AVPR1AP37288 418 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TUFMP49411 452 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ARSDP51689 593 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 EPHB1P54762 984 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ATP6V0D1P61421 351 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 DSC2Q02487 901 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SULT2A1Q06520 285 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ITKQ08881 620 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CDC16Q13042 620 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ART3Q13508 389 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SEPT6Q14141 434 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CSHL1Q14406 222 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SQLEQ14534 574 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 GPNMBQ14956 572 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TYSND1Q2T9J0 566 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 MAP7D1Q3KQU3 841 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 UGT3A2Q3SY77 523 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 UNC50Q53HI1 259 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ZNF789Q5FWF6 425 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 C10orf120Q5SQS8 335 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 RAP1GAP2Q684P5 730 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TRIM68Q6AZZ1 485 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SLC8B1Q6J4K2 584 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TMEM154Q6P9G4 183 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TMEM207Q6UWW9 146 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ZNF783Q6ZMS7 281 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CHST9Q7L1S5 443 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SLC25A41Q8N5S1 370 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CCNYL1Q8N7R7 359 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ZNF511Q8NB15 262 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CATSPER1Q8NEC5 780 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PDZD8Q8NEN9 1154 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ADCY4Q8NFM4 1077 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 OR4L1Q8NH43 312 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SLC26A7Q8TE54 656 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 IFT43Q96FT9 208 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 MYRFLQ96LU7 910 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TTC1Q99614 292 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SEMA3CQ99985 751 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 MGME1Q9BQP7 344 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 GPR62Q9BZJ7 368 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 FAM192AQ9GZU8 254 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ATXN3LQ9H3M9 355 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 GSTO2Q9H4Y5 243 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 POMKQ9H5K3 350 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SEPT3Q9UH03 358 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TMCO1Q9UM00 188 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ASB3Q9Y575 518 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SLC38A8A6NNN8 435 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1P1-201ENST00000401029 F5H5T6 163 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1P1-201ENST00000401029 AIM2O14862 343 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1P1-201ENST00000401029 AURKAO14965 403 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1P1-201ENST00000401029 KLK8O60259 260 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1P1-201ENST00000401029 VPS4BO75351 444 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CRTAMO95727 393 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TBX18O95935 607 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1P1-201ENST00000401029 LINGO3P0C6S8 592 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1P1-201ENST00000401029 UQCRBP14927 111 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1P1-201ENST00000401029 VCLP18206 1134 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CR2P20023 1033 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1P1-201ENST00000401029 KCNA5P22460 613 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1P1-201ENST00000401029 OR1E1P30953 314 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ETFBP38117 255 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PPP3CCP48454 512 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1P1-201ENST00000401029 KCNC1P48547 511 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SLC11A2P49281 568 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1P1-201ENST00000401029 GPR15P49685 360 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CLCN4P51793 760 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SESN3P58005 492 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1P1-201ENST00000401029 HERVK_113P63132 956 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PRAMEP78395 509 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1P1-201ENST00000401029 GNA12Q03113 381 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1P1-201ENST00000401029 BFSP2Q13515 415 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CEACAM7Q14002 265 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1P1-201ENST00000401029 LRP8Q14114 963 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1P1-201ENST00000401029 GRM2Q14416 872 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PCSK7Q16549 785 aa8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.6 ms