RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372478.4

C9orf50-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 50, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene C9orf50, Length 1,620 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf50-201ENST00000372478 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa25.26■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 PRELID2Q8N945 189 aa25.26■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa25.26■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 TLR4O00206 839 aa25.25■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 FPGTO14772 594 aa25.25■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 ANXA9O76027 345 aa25.25■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 METTL18O95568 372 aa25.25■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 IFNB1P01574 187 aa25.25■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 IGFALSP35858 605 aa25.25■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 GEMP55040 296 aa25.25■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 PRPSAP1Q14558 356 aa25.25■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 IRF4Q15306 451 aa25.25■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa25.25■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 PRUNE1Q86TP1 453 aa25.25■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 SLC25A41Q8N5S1 370 aa25.25■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 DENND6BQ8NEG7 585 aa25.25■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 OR13H1Q8NG92 308 aa25.25■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 SKA1Q96BD8 255 aa25.25■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 RTP4Q96DX8 246 aa25.25■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 KLHDC7BQ96G42 594 aa25.25■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 COQ10AQ96MF6 247 aa25.25■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 AP1M1Q9BXS5 423 aa25.25■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 DMXL1Q9Y485 3027 aa25.24■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 ITGAVP06756 1048 aa25.24■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 THEGLP0DJG4 465 aa25.24■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 STIP1P31948 543 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 CTSKP43235 329 aa25.24■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 CHRNA4P43681 627 aa25.24■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 KCNJ1P48048 391 aa25.24■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 LRRC14Q15048 493 aa25.24■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 FAXCQ5TGI0 409 aa25.24■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 CCDC70Q6NSX1 233 aa25.24■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 IQCHQ86VS3 1027 aa25.24■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 MINDY1Q8N5J2 469 aa25.24■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa25.24■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 TMEM9BQ9NQ34 198 aa25.24■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 A6NNZ2 444 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 CLDN7O95471 211 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 ETS1P14921 441 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 ETV3P41162 512 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 OLIG2Q13516 323 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 HLA-BQ31612 363 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 SIRPB2Q5JXA9 342 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 Q6ZSR6 202 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 RFLNAQ6ZTI6 216 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 SPATA4Q8NEY3 305 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 LYSMD1Q96S90 227 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 FICDQ9BVA6 458 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 FSD1LQ9BXM9 530 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 IL21RQ9HBE5 538 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 C4orf47A7E2U8 309 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 AGTP01019 485 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 PCCBP05166 539 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 C1SP09871 688 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 NXPH1P58417 271 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 PTSQ03393 145 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 AGERQ15109 404 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 PARP6Q2NL67 630 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 P3H1Q32P28 736 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 STPG1Q5TH74 334 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 Q6ZVL8 140 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 GLIS1Q8NBF1 620 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 APOL2Q9BQE5 337 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 GAREM1Q9H706 876 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 PSMD11O00231 422 aa25.22■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 OVGP1Q12889 678 aa25.22■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 CDKN3Q16667 212 aa25.22■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa25.22■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa25.22■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 PLA2G15Q8NCC3 412 aa25.22■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 HOMER3Q9NSC5 361 aa25.22■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 SHOC2Q9UQ13 582 aa25.22■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 SPO11Q9Y5K1 396 aa25.22■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 EPOP01588 193 aa25.21■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 SLC4A1P02730 911 aa25.21■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 ZNF30P17039 623 aa25.21■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 STC1P52823 247 aa25.21■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 SPARCL1Q14515 664 aa25.21■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 SLC1A5Q15758 541 aa25.21■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 UAP1L1Q3KQV9 507 aa25.21■■□□□ 1.63
C9orf50-201ENST00000372478 IL27RAQ6UWB1 636 aa25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms