RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343257.6

CLCN1-201, Transcript of chloride voltage-gated channel 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLCN1, Length 3,172 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN1-201ENST00000343257 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 DNERQ8NFT8 737 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 PSMA8Q8TAA3 256 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 LPAR1Q92633 364 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 OLFM1Q99784 485 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 NACA2Q9H009 215 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 CYP3A43Q9HB55 503 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 HMG20AQ9NP66 347 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 PALMDQ9NP74 551 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 ABCB10Q9NRK6 738 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 BAG5Q9UL15 447 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 RAD54BQ9Y620 910 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 WDR81Q562E7 1941 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 LTBP1Q14766 1721 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 A0A087WZ62 844 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 CCL22O00626 93 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 SEC14L2O76054 403 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 NADKO95544 446 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 SLC1A2P43004 574 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 GLUD2P49448 558 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 ACAP2Q15057 778 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 KRT27Q7Z3Y8 459 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 SPRED1Q7Z699 444 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 KIAA2013Q8IYS2 634 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 LGI2Q8N0V4 545 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 HDAC11Q96DB2 347 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 SLC30A3Q99726 388 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 ALG9Q9H6U8 611 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 MEAF6Q9HAF1 191 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 SMURF2Q9HAU4 748 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 VTA1Q9NP79 307 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 TMEM9Q9P0T7 183 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 NPHS1O60500 1241 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 TCF3P15923 654 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 SLC6A2P23975 617 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 RFC2P35250 354 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 TGFBR1P36897 503 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 CXCR3P49682 368 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 NDUFV1P49821 464 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 HK2P52789 917 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 DGCR6Q14129 220 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 NOMO2Q5JPE7 1267 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 NDNFQ8TB73 568 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 ITCHQ96J02 903 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 CHID1Q9BWS9 393 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 CD320Q9NPF0 282 aa14.89□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 LINC00032P0C843 101 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 GSK3BP49841 420 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 VBP1P61758 197 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 ECT2LQ008S8 904 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 LAPTM5Q13571 262 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 NFYCQ13952 458 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 SYPL2Q5VXT5 272 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 XRRA1Q6P2D8 792 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 CYHR1Q6ZMK1 362 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 SPARTQ8N0X7 666 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 NPWQ8N729 165 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 SLC22A17Q8WUG5 538 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 ANAPC2Q9UJX6 822 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 ERVK-11Q9UQG0 969 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 NDUFAF1Q9Y375 327 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 NRXN2Q9P2S2 1712 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 TRIM64A6NGJ6 449 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 AQP12BA6NM10 295 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 M0R3G1 203 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 AGRPO00253 132 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 SLC4A1P02730 911 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 CYP2B6P20813 491 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 GPX3P22352 226 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 LMO2P25791 158 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 FOXA1P55317 472 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 ATP6V0D1P61421 351 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 TRIM32Q13049 653 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 UGT3A2Q3SY77 523 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 BTBD8Q5XKL5 378 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 EFCAB12Q6NXP0 572 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 CCDC81Q6ZN84 652 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 CATSPER4Q7RTX7 472 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 HEATR4Q86WZ0 1026 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 AQP12AQ8IXF9 295 aa14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 KCNC1P48547 511 aa14.87□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 LIPEQ05469 1076 aa14.87□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 ADCK1Q86TW2 530 aa14.87□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 ABI1Q8IZP0 508 aa14.87□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 NUDT8Q8WV74 236 aa14.87□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 ZUFSPQ96AP4 578 aa14.87□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 TUBGCP3Q96CW5 907 aa14.87□□□□□ -0.03
CLCN1-201ENST00000343257 LRRC58Q96CX6 371 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms