RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 KRT33AO76009 404 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 DDNO94850 711 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 LRIG2O94898 1065 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 NFATC1O95644 943 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CST1P01037 141 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RHOQP17081 205 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ERCC2P18074 760 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SPAM1P38567 509 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CAPGP40121 348 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 NDST2P52849 883 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CDH4P55283 916 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 GALNT3Q14435 633 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TATDN1Q6P1N9 297 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CES3Q6UWW8 571 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CYP2R1Q6VVX0 501 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CERS6Q6ZMG9 384 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ZFPM1Q8IX07 1006 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 HAS1Q92839 578 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 COPS8Q99627 209 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ING4Q9UNL4 249 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ELFN1P0C7U0 828 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ICAM3P32942 547 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RHBDL3P58872 404 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TAS2R41P59536 307 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 VBP1P61758 197 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SLC20A2Q08357 652 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TUSC3Q13454 348 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PDK3Q15120 406 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TMEM44Q2T9K0 475 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 BICRALQ6AI39 1079 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RGMBQ6NW40 437 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 LCLAT1Q6UWP7 414 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 JAZF1Q86VZ6 243 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TRPV3Q8NET8 790 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 BAP1Q92560 729 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 HAVCR1Q96D42 359 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CORO1BQ9BR76 489 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TTPALQ9BTX7 342 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 GLOD4Q9HC38 313 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PTGFRNQ9P2B2 879 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 BTBD3Q9Y2F9 522 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PRNPP04156 253 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RPL4P36578 427 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 OMPP47874 163 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 BEX3Q00994 111 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ZYG11AQ6WRX3 759 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ARMCX6Q7L4S7 300 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 AHI1Q8N157 1196 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 KLHL23Q8NBE8 558 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 LEMD2Q8NC56 503 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CYP2W1Q8TAV3 490 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 STYXQ8WUJ0 223 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 KCTD4Q8WVF5 259 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 DNAJC11Q9NVH1 559 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 FAM86C2PA6NEL3 165 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SELPP16109 830 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 HSD17B2P37059 387 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PTPN9P43378 593 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CXCR3P49682 368 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ATP1A4Q13733 1029 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RUNDC3AQ59EK9 446 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 XKR4Q5GH76 650 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CHADLQ6NUI6 762 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 DET1Q7L5Y6 550 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SLC26A9Q7LBE3 791 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 BNIPLQ7Z465 357 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SVOPLQ8N434 492 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SMYD1Q8NB12 490 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CNTNAP1P78357 1384 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 MCIDASD6RGH6 385 aa7.21□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RFXANKO14593 260 aa7.21□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms