RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmco1Q921L3 188 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Plpp3Q99JY8 312 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 L3hypdhQ9CXA2 354 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Clca1Q9D7Z6 913 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc70Q9D9B0 223 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Q9DA42 136 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Aldh7a1Q9DBF1 539 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rpn2Q9DBG6 631 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tdp2Q9JJX7 370 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Clec1bQ9JL99 229 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rps6kb2Q9Z1M4 485 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Net1Q9Z206 595 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 MycsQ9Z304 431 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Scn8aQ9WTU3 1978 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Igkv10-94A0A075B5L1 115 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vsig10l2A0A140LHF2 776 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp612A0A1D5RMC2 672 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm21964A0A1W2P7S4 437 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 A0A286YCD0 109 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zmynd12A2BGJ5 363 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp472B0V2W5 534 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn2r74E9PW21 853 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ttc7bE9Q6P5 843 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm5689F6Y2A6 97 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sgo2bJ3QMK1 1167 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm5814J3QP80 125 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cd151O35566 253 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gp1baO35930 734 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Yme1l1O88967 715 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm5571P01639 130 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 P01669 111 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PolP11369 1281 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 CryaaP24622 196 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 RxraP28700 467 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 LdlrP35951 862 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 SmoP56726 793 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 E2f2P56931 443 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ythdf1P59326 559 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ctps2P70303 586 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Wbp2P97765 261 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp217Q3U0X6 1041 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zmym5Q3U2E2 627 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Arhgap17Q3UIA2 846 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam196aQ3USH1 422 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trim80Q3V061 624 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 HecaQ3V1N5 544 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam160a1Q505K2 1081 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Adam2Q60718 735 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Chi3l1Q61362 389 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 MslnQ61468 625 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Grid2Q61625 1007 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 ProcrQ64695 242 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Q6P2K3 674 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 DgkqQ6P5E8 934 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm7247Q6UY52 187 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc39a4Q78IQ7 660 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rassf6Q80UQ2 353 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zbtb41Q811F1 908 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc38a9Q8BGD6 560 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Smoc1Q8BLY1 463 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 HadhaQ8BMS1 763 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sit1Q8C503 180 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 RtknQ8C6B2 564 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Impg1Q8R1W8 798 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tspan33Q8R3S2 283 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ssx2ipQ8VC66 615 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Med17Q8VCD5 649 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Stx18Q8VDS8 334 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ppp1r16aQ923M0 524 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ubox5Q925F4 539 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cdk9Q99J95 372 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Yaf2Q99LW6 179 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cyp4f13Q99N19 523 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sytl1Q99N80 567 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vps28Q9D1C8 221 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 SarnpQ9D1J3 210 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cdyl2Q9D5D8 503 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tex9Q9D845 387 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dtwd1Q9D8U7 304 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Aldh1a3Q9JHW9 512 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Actl7bQ9QY83 418 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Actl7aQ9QY84 440 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Grm3Q9QYS2 879 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ak1Q9R0Y5 194 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gria4Q9Z2W8 902 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vps13aQ5H8C4 3166 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Znf536Q8K083 1302 aa9.27□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mroh7A2AVR2 1279 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zbed5B2RPU8 756 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ech1O35459 327 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Aldh1a7O35945 501 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pitx1P70314 315 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Smad4P97471 551 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Uba1Q02053 1058 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PrkcqQ02111 707 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Myadml2Q08AU7 307 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc127Q3TC33 260 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ermp1Q3UVK0 898 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dyrk2Q5U4C9 599 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Acbd5Q5XG73 508 aa9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.2 ms