RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021056.7

Scn4a-201, Transcript of Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Scn4a, Length 6,598 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Ppef1O35655 650 aa9.51□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Cdh16O88338 830 aa9.51□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 PrkchP23298 683 aa9.51□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Npbwr1P49681 329 aa9.51□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Nat3P50296 290 aa9.51□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Zfp953Q3UPV7 304 aa9.51□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Btg1-ps1Q3V0S2 161 aa9.51□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Btg1-ps2Q3V0X0 161 aa9.51□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 VwdeQ6DFV8 926 aa9.51□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Klhdc10Q6PAR0 439 aa9.51□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Plekha1Q8BUL6 383 aa9.51□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 B3gnt7Q8K0J2 397 aa9.51□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Grhl1Q921D9 618 aa9.51□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Ints11Q9CWS4 600 aa9.51□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 EbplQ9D0P0 206 aa9.51□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Erp27Q9D8U3 272 aa9.51□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Rpf2Q9JJ80 306 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Znf354bQ9QXT9 601 aa9.51□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Arid3bQ9Z1N7 568 aa9.51□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Arhgap36B1AUC7 590 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Slc25a54B1AUS6 473 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Tmigd3G3X8R9 209 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 AipO08915 330 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Ifrd1P19182 449 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Adra1dP97714 562 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Acss3Q14DH7 682 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Mier2Q3U3N0 541 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Foxn3Q499D0 457 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 CcnjlQ5SRT8 387 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Psd2Q6P1I6 770 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Cacnb2Q8CC27 655 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Hpf1Q8CFE2 346 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Tbc1d13Q8R3D1 400 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Rab30Q923S9 203 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Riok2Q9CQS5 547 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Fam212aQ9CX62 282 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Ift43Q9DA69 206 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Ggta1l1A2AUQ7 319 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 PrkcdP28867 674 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Ccnb2P30276 398 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Ppm1bP36993 390 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Capza1P47753 286 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Snrpd1P62315 119 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Gcnt1Q09324 428 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Phc1Q64028 1012 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Nr2e1Q64104 385 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Pcdh20Q8BIZ0 952 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Olfr806Q8VFI2 313 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Acot13Q9CQR4 140 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Spaca7Q9D2S4 182 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Gabra4Q9D6F4 552 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 KelQ9EQF2 713 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Katna1Q9WV86 491 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Naaladl2A0A0N4SUJ3 795 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Fam171a1A2ATK9 892 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Fbxl18E9PYR1 771 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Alkbh1P0CB42 389 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 FesP16879 822 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 NadkP58058 439 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Aars2Q14CH7 980 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Fam126aQ6P9N1 521 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Clic5Q8BXK9 251 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Tnfaip8l1Q8K288 186 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Sash3Q8K352 380 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Sbk1Q8QZX0 417 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Olfr1090Q8VGA6 313 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Olfr808Q8VGI8 312 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Rab25Q9WTL2 213 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Gm16506F7ANP4 213 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Gm6356L7N2A7 188 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Serpinb9eO08806 377 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Rpl36P47964 105 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Brms1lQ3U1T3 323 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 LbpQ61805 481 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 PostnQ62009 838 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Ube2r2Q6ZWZ2 238 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 PdhxQ8BKZ9 501 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Wwp1Q8BZZ3 918 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Ints5Q8CHT3 1018 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Olfr853Q8VGG6 305 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Gatad2bQ8VHR5 594 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Pcdhgc5Q91XW9 944 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Oma1Q9D8H7 521 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Rpl9-ps1S4R1R7 191 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Man1b1A2AJ15 658 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Kcnu1O54982 1121 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Lta4hP24527 611 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Neurl1bQ0MW30 546 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Nt5c2Q3V1L4 560 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Kansl1lQ5DTI6 991 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Cypt2Q6P924 180 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Tsen34Q8BMZ5 316 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Slc18a2Q8BRU6 517 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Mrps23Q8VE22 177 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Olfr345Q8VGK4 311 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Borcs5Q9D920 195 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 TheglQ9DA15 459 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Myg1Q9JK81 380 aa9.5□□□□□ -0.89
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Olfr271-ps1A0A1L1SQH2 283 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.3 ms