RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616920.1

CYCSP41-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 41, humanhuman

BASIC

Gene CYCSP41, Length 296 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP41-201ENST00000616920 LDLRAD4O15165 306 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 CREB3O43889 395 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 PPP1R3DO95685 299 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 F9P00740 461 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 MMP2P08253 660 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 ABCD1P33897 745 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 GNAQP50148 359 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP4.9□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 C9orf57Q5W0N0 161 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP4.9□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 SLC35F3Q8IY50 421 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 SCCPDHQ8NBX0 429 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 CREB3L4Q8TEY5 395 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 ADGRG7Q96K78 797 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 LMLNQ96KR4 655 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 OR1F2PQ96R84 312 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 CSF3RQ99062 836 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 H2AFJQ9BTM1 129 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 UBN1Q9NPG3 1134 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 RCOR1Q9UKL0 485 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 NFS1Q9Y697 457 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 DISP1Q96F81 1524 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 KIAA0556O60303 1618 aa4.9□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 CCDC189A1A4V9 331 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 SEC14L5O43304 696 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 AFPP02771 609 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 CD58P19256 250 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 AGAP20933 346 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 GPTP24298 496 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 SHMT1P34896 483 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 HARS2P49590 506 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 COMPP49747 757 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 SORDQ00796 357 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 PTP4A2Q12974 167 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 EFNB3Q15768 340 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 CALCRLQ16602 461 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 KIF19Q2TAC6 998 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 SGO1Q5FBB7 561 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 FAM69BQ5VUD6 431 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 ACAD10Q6JQN1 1059 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 ARMC8Q8IUR7 673 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 DSELQ8IZU8 1212 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 ZBTB2Q8N680 514 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 AGBL3Q8NEM8 1001 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 CADM4Q8NFZ8 388 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 NFKBIDQ8NI38 313 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 SAAL1Q96ER3 474 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 SCMH1Q96GD3 660 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 AGXT2Q9BYV1 514 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 TKTL2Q9H0I9 626 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 SCINQ9Y6U3 715 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 DIP2BQ9P265 1576 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 TTC36A6NLP5 189 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 PRSS44E7EML9 344 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 WNT9BO14905 357 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 TNFSF14O43557 240 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 G6PDP11413 515 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 ATP1A3P13637 1013 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 STX2P32856 288 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 COASYQ13057 564 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 SNTA1Q13424 505 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 ALFQ53S48 1182 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 CNTROBQ8N137 903 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 ZNF114Q8NC26 417 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 BEST2Q8NFU1 509 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 HUS1BQ8NHY5 278 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 KXD1Q9BQD3 176 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 GPR108Q9NPR9 543 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 CNGB3Q9NQW8 809 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 EFCAB5A4FU69 1503 aa4.87□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 KIF21BO75037 1637 aa4.87□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 CFAP43Q8NDM7 1665 aa4.87□□□□□ -1.63
CYCSP41-201ENST00000616920 DENND3A2RUS2 1198 aa4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms