RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596016.5

STRN4-213, Transcript of striatin 4, human

TSL 4

Gene STRN4, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STRN4-213	ENST00000596016	MMP20	O60882	483 aa		13.57	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	TM7SF2	O76062	418 aa		13.57	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	IFNB1	P01574	187 aa		13.57	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	CCNC	P24863	283 aa		13.57	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	FOXC1	Q12948	553 aa		13.57	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	MARC1	Q5VT66	337 aa		13.57	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	ERAP2	Q6P179	960 aa		13.57	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016		Q6ZSR6	202 aa		13.57	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		13.57	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	PAF1	Q8N7H5	531 aa		13.57	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	OR13H1	Q8NG92	308 aa		13.57	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	SAP25	Q8TEE9	199 aa		13.57	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		13.57	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	LGMN	Q99538	433 aa		13.57	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		13.57	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		13.57	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		13.57	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		13.57	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	PLXNA2	O75051	1894 aa		13.57	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	CACNA1B	Q00975	2339 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	CACNA1E	Q15878	2313 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016		A0A1W2PQ67	120 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	POM121B	A6NF01	834 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	TRIM16	O95361	564 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	GAS8	O95995	478 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	CR2	P20023	1033 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	MMP13	P45452	471 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	RABIF	P47224	123 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	SHC2	P98077	582 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	C2orf54	Q08AI8	447 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	BNIP3	Q12983	259 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	PPP1R7	Q15435	360 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	PGBD5	Q8N414	524 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	TEX26	Q8N6G2	289 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	CENPT	Q96BT3	561 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	OLFM3	Q96PB7	478 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	KRT12	Q99456	494 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	MGME1	Q9BQP7	344 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		13.56	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	KCNK1	O00180	336 aa		13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	MATN3	O15232	486 aa		13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	ECEL1	O95672	775 aa		13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	CCNB1	P14635	433 aa		13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	RBL1	P28749	1068 aa		13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	FNTA	P49354	379 aa		13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	PRELID2	Q8N945	189 aa		13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	ATL2	Q8NHH9	583 aa		13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	FATE1	Q969F0	183 aa		13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	LRRC45	Q96CN5	670 aa		13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	IFT43	Q96FT9	208 aa		13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	TSGA13	Q96PP4	275 aa		13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	CARD6	Q9BX69	1037 aa		13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	NOD2	Q9HC29	1040 aa		13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	GPR27	Q9NS67	375 aa		13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		13.55	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	TNFSF14	O43557	240 aa		13.54	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	SOCS5	O75159	536 aa		13.54	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	JCHAIN	P01591	159 aa		13.54	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	PRKCG	P05129	697 aa		13.54	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		13.54	□□□□□ -0.24
STRN4-213	ENST00000596016	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24

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