RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	KL	Q9UEF7	1012 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	LHX6	Q9UPM6	363 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		9.43	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	PGLS	O95336	258 aa		9.42	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	KRT10	P13645	584 aa		9.42	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	TGM2	P21980	687 aa		9.42	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	KDELR1	P24390	212 aa		9.42	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	VIPR1	P32241	457 aa		9.42	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	MAN1A1	P33908	653 aa		9.42	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	TRIM23	P36406	574 aa		9.42	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	ARHGAP25	P42331	645 aa		9.42	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	GALNT2	Q10471	571 aa		9.42	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	TRAF2	Q12933	501 aa		9.42	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	DENND2C	Q68D51	928 aa		9.42	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		9.42	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	SCRN2	Q96FV2	425 aa		9.42	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	COQ10A	Q96MF6	247 aa		9.42	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	TSGA13	Q96PP4	275 aa		9.42	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	SEMA3C	Q99985	751 aa		9.42	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	9.42	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	PADI4	Q9UM07	663 aa		9.42	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		9.42	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		9.42	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		9.42	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	PTPRB	P23467	1997 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	IGF2R	P11717	2491 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A087WV48	116 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM202	A6NGA9	273 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	TNFRSF10C	O14798	259 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	MFSD11	O43934	449 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	MFAP3L	O75121	409 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	USP12	O75317	370 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	CS	O75390	466 aa	Known RBP	9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	MAP3K6	O95382	1288 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	CCNB1	P14635	433 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	CTPS1	P17812	591 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	GM2A	P17900	193 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	MX2	P20592	715 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	ACTN2	P35609	894 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	KIAA1024L	P59773	190 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	ARHGEF7	Q14155	803 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	TCEA2	Q15560	299 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	CNGA3	Q16281	694 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	USP45	Q70EL2	814 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	CNGA4	Q8IV77	575 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	LSMEM2	Q8N112	164 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	PQLC3	Q8N755	202 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	CCNY	Q8ND76	341 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	RAPGEF5	Q92565	580 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	MAML1	Q92585	1016 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	FGF11	Q92914	225 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	NAT6	Q93015	286 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	FATE1	Q969F0	183 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	FAF2	Q96CS3	445 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	NUS1	Q96E22	293 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	RNF157	Q96PX1	679 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	LGR4	Q9BXB1	951 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	WDR26	Q9H7D7	661 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	AMACR	Q9UHK6	382 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	GPR34	Q9UPC5	381 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		9.41	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	PSMD11	O00231	422 aa		9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	FZD6	O60353	706 aa		9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	BRINP1	O60477	761 aa		9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	MTA2	O94776	668 aa		9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	PDHA1	P08559	390 aa		9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	ETV3	P41162	512 aa		9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	EPHB1	P54762	984 aa		9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	DSC2	Q02487	901 aa		9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	GBE1	Q04446	702 aa		9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	PTPRR	Q15256	657 aa		9.4	□□□□□ -0.9
KIFC3-231	ENST00000567479	ISX	Q2M1V0	245 aa		9.4	□□□□□ -0.9

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