RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554184.5

CCNB1IP1-210, Transcript of cyclin B1 interacting protein 1, human

TSL 3

Gene CCNB1IP1, Length 513 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNB1IP1-210	ENST00000554184		I6L893	689 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CHL1	O00533	1208 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PGM3	O95394	542 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TUBB	P07437	444 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GABRB1	P18505	474 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PIGA	P37287	484 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	THPO	P40225	353 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PSMB10	P40306	273 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PMS2	P54278	862 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	P2RX3	P56373	397 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PRAME	P78395	509 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	BECN1	Q14457	450 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TCTN1	Q2MV58	587 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SHC4	Q6S5L8	630 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NEK9	Q8TD19	979 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZNF570	Q96NI8	536 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SERINC2	Q96SA4	455 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	KLHL31	Q9H511	634 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FBXL17	Q9UF56	701 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MAPKBP1	O60336	1514 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	UTY	O14607	1347 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TIAM1	Q13009	1591 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	KDM6B	O15054	1643 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SYNJ2	O15056	1496 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184		B4DLN1	442 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MDM4	O15151	490 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	P4HA2	O15460	535 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SLC25A12	O75746	678 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TSPAN9	O75954	239 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	EPN2	O95208	641 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	IFNA2	P01563	188 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	RB1	P06400	928 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FGF2	P09038	288 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SELL	P14151	372 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PRF1	P14222	555 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	RRM1	P23921	792 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SELENOV	P59797	346 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FAM27E3	Q08E93	113 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	STK4	Q13043	487 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TRAF1	Q13077	416 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NAE1	Q13564	534 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	RABEP1	Q15276	862 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	DUSP6	Q16828	381 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CDON	Q4KMG0	1287 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	RAB41	Q5JT25	222 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SARM1	Q6SZW1	724 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PIP4P1	Q86T03	277 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SCML4	Q8N228	414 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TEX45	Q8NA69	505 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FBXL8	Q96CD0	374 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	COQ8B	Q96D53	544 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	APOLD1	Q96LR9	279 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ISCU	Q9H1K1	167 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PDE7B	Q9NP56	450 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SETD4	Q9NVD3	440 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MTMR6	Q9Y217	621 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		4.13	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms