RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	NR1D1	P20393	614 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	NUDT1	P36639	197 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	CASR	P41180	1078 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	CCR10	P46092	362 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	CDH4	P55283	916 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	POLE2	P56282	527 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	KCNAB2	Q13303	367 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	LRRC38	Q5VT99	294 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	ZNF787	Q6DD87	383 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	DAAM2	Q86T65	1068 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	PARG	Q86W56	976 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	KY	Q8NBH2	561 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	HSPH1	Q92598	858 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	EPAS1	Q99814	870 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	LRRC61	Q9BV99	259 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	CREBBP	Q92793	2442 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	ATP9B	O43861	1147 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	CREB3	O43889	395 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	JMJD7	P0C870	316 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	EPHB2	P29323	1055 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	CHRNA3	P32297	505 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	NNMT	P40261	264 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	HCAR3	P49019	387 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	ARSE	P51690	589 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	INHBC	P55103	352 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	ARSI	Q5FYB1	569 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	KCTD16	Q68DU8	428 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	XKR5	Q6UX68	686 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	LINGO4	Q6UY18	593 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	NLRP14	Q86W24	1093 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	FAM71B	Q8TC56	605 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	ITM2B	Q9Y287	266 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	WASH4P	A8MWX3	477 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222		D6RAR5	112 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222		K7EM74	188 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	PSTPIP1	O43586	416 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	SPOP	O43791	374 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	SFTPC	P11686	197 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	SRC	P12931	536 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	TSHR	P16473	764 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	GJC1	P36383	396 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	ARSD	P51689	593 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	MLLT10	P55197	1068 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	OXCT1	P55809	520 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	TPI1	P60174	286 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	RFX8	Q6ZV50	586 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	DTX1	Q86Y01	620 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	IFT43	Q96FT9	208 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	IGLON5	A6NGN9	336 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	ENO4	A6NNW6	628 aa		13.92	□□□□□ -0.18

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