RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 RAD51Q06609 339 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 SLC10A7Q0GE19 358 aa9.73□□□□□ -0.85
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CS-217ENST00000550044 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 ODF2Q5BJF6 829 aa9.73□□□□□ -0.85
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CS-217ENST00000550044 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 FBXL19Q6PCT2 694 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 GDPD4Q6W3E5 623 aa9.73□□□□□ -0.85
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CS-217ENST00000550044 TPCN2Q8NHX9 752 aa9.73□□□□□ -0.85
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CS-217ENST00000550044 A0A1W2PPC4 97 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 C16orf96A6NNT2 1141 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 WNT9AO14904 365 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 MUSKO15146 869 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 SLC7A4O43246 635 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 MFSD11O43934 449 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
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CS-217ENST00000550044 PIGNO95427 931 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 JUPP14923 745 aa9.72□□□□□ -0.85
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CS-217ENST00000550044 CD27P26842 260 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 HNF1BP35680 557 aa9.72□□□□□ -0.85
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CS-217ENST00000550044 SCNN1BP51168 640 aa9.72□□□□□ -0.85
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CS-217ENST00000550044 TLE3Q04726 772 aa9.72□□□□□ -0.85
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CS-217ENST00000550044 LRRC73Q5JTD7 316 aa9.72□□□□□ -0.85
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CS-217ENST00000550044 LRRC38Q5VT99 294 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 LAYNQ6UX15 382 aa9.72□□□□□ -0.85
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CS-217ENST00000550044 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
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CS-217ENST00000550044 ATPAF2Q8N5M1 289 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 FAM131CQ96AQ9 280 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 ORAI3Q9BRQ5 295 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 HDAC8Q9BY41 377 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 GRPEL1Q9HAV7 217 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 TM9SF3Q9HD45 589 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 FTSJ1Q9UET6 329 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 HEY1Q9Y5J3 304 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 A0A1W2PQU0 124 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 MACROD2A1Z1Q3 448 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 B8ZZF3 427 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 KCNK3O14649 394 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 SLC31A1O15431 190 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 PJA2O43164 708 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 SLC28A2O43868 658 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 PEX11BO96011 259 aa9.71□□□□□ -0.86
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CS-217ENST00000550044 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP9.71□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 ITKQ08881 620 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 GALNT2Q10471 571 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 KIF5AQ12840 1032 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 LY6DQ14210 128 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 ZNF235Q14590 738 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
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