RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 PARD6AQ9NPB6 346 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 PKD2L2Q9NZM6 624 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 PAK5Q9P286 719 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 B4GALT6Q9UBX8 382 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 PYCARDQ9ULZ3 195 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A1W2PR77 199 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 LNP1A1A4G5 178 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 PMPCBO75439 489 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 FGF1P05230 155 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 TEAD1P28347 426 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 CXCR5P32302 372 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 THOP1P52888 689 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 WNT3AP56704 352 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 GRIK2Q13002 908 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 MTM1Q13496 603 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 LAMB3Q13751 1172 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 PCSK7Q16549 785 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 LINC00523Q86TU6 105 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 ZSWIM9Q86XI8 627 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM71DQ8N9W8 422 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 GRK7Q8WTQ7 553 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 CENPTQ96BT3 561 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 CEP41Q9BYV8 373 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 ITM2BQ9Y287 266 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 SAR1BQ9Y6B6 198 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 SHROOM3Q8TF72 1996 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 PPFIA2O75334 1257 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 GJB3O75712 270 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 PDHA1P08559 390 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 THEGLP0DJG4 465 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 TSHRP16473 764 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 CD68P34810 354 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 HNF1BP35680 557 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 OASLQ15646 514 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC6Q16204 474 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 QPCTQ16769 361 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF765Q7L2R6 523 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 SPATA22Q8NHS9 363 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 BTN2A2Q8WVV5 523 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 C1orf54Q8WWF1 131 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 KLK6Q92876 244 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 C19orf43Q9BQ61 176 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 LRRC40Q9H9A6 602 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 EBF2Q9HAK2 575 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM186AA6NE01 2351 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 GPR179Q6PRD1 2367 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A1B0GVT2 93 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 PATE3B3GLJ2 98 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 E7EVH7 732 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 H3BM21 787 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 SPINT1O43278 529 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 PRLP01236 227 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 IFNB1P01574 187 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 CASQ1P31415 396 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 CTSKP43235 329 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 LMAN1P49257 510 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 CCT8P50990 548 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 BLKP51451 505 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 NXPH1P58417 271 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 DPTQ07507 201 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 RALGDSQ12967 914 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC1A5Q15758 541 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 CNGA3Q16281 694 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF423Q2M1K9 1284 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 LRRC73Q5JTD7 316 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 CRTC1Q6UUV9 634 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 KDELC1Q6UW63 502 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 Q6ZSR6 202 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 IPMKQ8NFU5 416 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC110Q8TBZ0 833 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 NUS1Q96E22 293 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 COQ10AQ96MF6 247 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 NSMCE3Q96MG7 304 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 TRIB3Q96RU7 358 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms