RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491569.5

ATP6AP1-209, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene ATP6AP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1-209ENST00000491569 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 CPA6Q8N4T0 437 aa20.63■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 DENND1AQ8TEH3 1009 aa20.63■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 VPS39Q96JC1 886 aa20.63■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 FAM167BQ9BTA0 163 aa20.63■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 FBXO5Q9UKT4 447 aa20.63■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 C2orf81A6NN90 581 aa20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 SLC7A4O43246 635 aa20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 SIN3BO75182 1162 aa20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 RPP40O75818 363 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 HAUS5O94927 633 aa20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 PRSS56P0CW18 603 aa20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 OPRD1P41143 372 aa20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 GRIA4P48058 902 aa20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 GRM3Q14832 879 aa20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 PPM1JQ5JR12 505 aa20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 NDUFAF2Q8N183 169 aa20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 TTC30BQ8N4P2 665 aa20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 DYDC1Q8WWB3 177 aa20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 EID2BQ96D98 161 aa20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 CHFRQ96EP1 664 aa20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 APOPT1Q96IL0 206 aa20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 MFSD1Q9H3U5 465 aa20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 SUV39H2Q9H5I1 410 aa20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 SAT1P21673 171 aa20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 ZNF711Q9Y462 761 aa20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 NUMBLQ9Y6R0 609 aa20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 A0A0J9YYE9 177 aa20.61■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 COPEO14579 308 aa20.61■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 TRBC1P01850 177 aa20.61■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 LPOP22079 712 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 HNF1BP35680 557 aa20.61■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 COL19A1Q14993 1142 aa20.61■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 LRRC73Q5JTD7 316 aa20.61■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 CNSTQ6PJW8 725 aa20.61■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 PHTF2Q8N3S3 785 aa20.61■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 CENPTQ96BT3 561 aa20.61■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 RHOJQ9H4E5 214 aa20.61■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa20.61■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 GRID1Q9ULK0 1009 aa20.61■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 PLA2G4CQ9UP65 541 aa20.61■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 ASLP04424 464 aa20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 TYK2P29597 1187 aa20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 CCNFP41002 786 aa20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 NEK3P51956 506 aa20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 RAD51Q06609 339 aa20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 CILP2Q8IUL8 1156 aa20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 PEX13Q92968 403 aa20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 LRCH3Q96II8 777 aa20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 GPR63Q9BZJ6 419 aa20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 MAGEE1Q9HCI5 957 aa20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 SNX15Q9NRS6 342 aa20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 SLC39A10Q9ULF5 831 aa20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 TBC1D3BA6NDS4 549 aa20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 STX7O15400 261 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 TIMM44O43615 452 aa20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 HLA-EP13747 358 aa20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 SOX9P48436 509 aa20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 SEMA3AQ14563 771 aa20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 ARSIQ5FYB1 569 aa20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 LVRNQ6Q4G3 990 aa20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 SPNS2Q8IVW8 549 aa20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 TERB1Q8NA31 727 aa20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 OR4L1Q8NH43 312 aa20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 CALML6Q8TD86 181 aa20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 ECHDC3Q96DC8 303 aa20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 KLHL32Q96NJ5 620 aa20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 FKBPLQ9UIM3 349 aa20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 RIMKLBQ9ULI2 386 aa20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 COL4A3Q01955 1670 aa20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 A6NNZ2 444 aa20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 ECI2O75521 394 aa20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 LEFTY1O75610 366 aa20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 ASMTLO95671 621 aa20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 CTSLP07711 333 aa20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 RPL26P61254 145 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 ST8SIA6P61647 398 aa20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms