RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 F5P12259 2224 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 A0A0J9YYE9 177 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ESYT3A0FGR9 886 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 HEATR9A2RTY3 570 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 C16orf96A6NNT2 1141 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 UPK3BL1B0FP48 263 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 UPK3BL2E5RIL1 263 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ERLIN1O75477 346 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 TMEM63AO94886 807 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 PIGNO95427 931 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CRTAMO95727 393 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 TTC4O95801 387 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 TRBC1P01850 177 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CTSLP07711 333 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 GSTA2P09210 222 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ACADMP11310 421 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 TSHRP16473 764 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ZNF30P17039 623 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ADRA1DP25100 572 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 PMLP29590 882 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 HOXA6P31267 233 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 SLC8A1P32418 973 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 WASP42768 502 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CARSP49589 748 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 RPS14P62263 151 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 GAS6Q14393 721 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 IHHQ14623 411 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 BRD3Q15059 726 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CSRP2Q16527 193 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 UGP2Q16851 508 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 PCID2Q5JVF3 399 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 SIRPB2Q5JXA9 342 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ANKRD22Q5VYY1 191 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 FBXL19Q6PCT2 694 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 TMPRSS6Q8IU80 811 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 OR52K1Q8NGK4 314 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 OR6K2Q8NGY2 324 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 FAM131CQ96AQ9 280 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 SIPA1Q96FS4 1042 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 PARD6BQ9BYG5 372 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 RAD18Q9NS91 495 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP11.75□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CAPN8A6NHC0 703 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 C2orf81A6NN90 581 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 F5H423 210 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 PSMD11O00231 422 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ZNF217O75362 1048 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 GJB3O75712 270 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 PDHA1P08559 390 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 GKP32189 559 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CCDC6Q16204 474 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 QPCTQ16769 361 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 SPDYCQ5MJ68 293 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 NEK5Q6P3R8 708 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 EMBQ6PCB8 327 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ZNF534Q76KX8 674 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CEP68Q76N32 757 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 TTC7BQ86TV6 843 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CNPY4Q8N129 248 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 LPCAT1Q8NF37 534 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 TSTD1Q8NFU3 115 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 MRGPRX1Q96LB2 322 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 NSMCE3Q96MG7 304 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 TTC25Q96NG3 672 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 OMDQ99983 421 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CDH19Q9H159 772 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 MTG2Q9H4K7 406 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 SAMD15Q9P1V8 674 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 EBF1Q9UH73 591 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 SARDHQ9UL12 918 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 NFU1Q9UMS0 254 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CCDC151A5D8V7 595 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 RGSL1A5PLK6 1076 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 TSPAN6O43657 245 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 USP12O75317 370 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 SPAG6O75602 509 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 APBB3O95704 486 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 IGLV3-19P01714 112 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 PROS1P07225 676 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ADRB3P13945 408 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 TIMP2P16035 220 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 PSMA3P25788 255 aa11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms