RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 ZNF34Q8IZ26 560 aa2.68□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 ZMIZ2Q8NF64 920 aa2.68□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 WDR20Q8TBZ3 569 aa2.68□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 HSPH1Q92598 858 aa2.68□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa2.68□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 ASCL2Q99929 193 aa2.68□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 TMEM160Q9NX00 188 aa2.68□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 CDC23Q9UJX2 597 aa2.68□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 OR2W1Q9Y3N9 320 aa2.68□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 CLDN16Q9Y5I7 305 aa2.68□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 HSPB2A8KAH6 182 aa2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 CAND2O75155 1236 aa2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 MTA2O94776 668 aa2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 CD48P09326 243 aa2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 PRSS56P0CW18 603 aa2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 DPEP1P16444 411 aa2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 S1PR1P21453 382 aa2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 MAP2K2P36507 400 aa2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 NEK3P51956 506 aa2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 TERF1P54274 439 aa2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 PNLIPRP1P54315 467 aa2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 GOLGA8FQ08AF8 430 aa2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 HSPB2Q16082 182 aa2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 WDR38Q5JTN6 314 aa2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 LINS1Q8NG48 757 aa2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 TAAR8Q969N4 342 aa2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 IWS1Q96ST2 819 aa2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 CMKLR1Q99788 373 aa2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 MYD88Q99836 296 aa2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 CABLES2Q9BTV7 478 aa2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 ARNT2Q9HBZ2 717 aa2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 TMLHEQ9NVH6 421 aa2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 RCOR1Q9UKL0 485 aa2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 C2CD2Q9Y426 696 aa2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 KLRF2D3W0D1 207 aa2.66□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 PSMD14O00487 310 aa2.66□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 PRC1O43663 620 aa2.66□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 WDR1O75083 606 aa2.66□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 KRT18P05783 430 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 GNB3P16520 340 aa2.66□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 TECP42680 631 aa2.66□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 CLCNKAP51800 687 aa2.66□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 TBX4P57082 545 aa2.66□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 PICALMQ13492 652 aa2.66□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 EDRF1Q3B7T1 1238 aa2.66□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa2.66□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa2.66□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 GJB7Q6PEY0 223 aa2.66□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 MOB3CQ70IA8 216 aa2.66□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 SRLQ86TD4 932 aa2.66□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 FOXRED2Q8IWF2 684 aa2.66□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 C1orf87Q8N0U7 546 aa2.66□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 GOLGA1Q92805 767 aa2.66□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 SGCZQ96LD1 299 aa2.66□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 HAUS8Q9BT25 410 aa2.66□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 NUF2Q9BZD4 464 aa2.66□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 TMEM30AQ9NV96 361 aa2.66□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 MCM9Q9NXL9 1143 aa2.66□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 CACNG5Q9UF02 275 aa2.66□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 A3GALT2U3KPV4 340 aa2.66□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 E7EVH7 732 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-210ENST00000487548 H7C423 109 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-210ENST00000487548 EBAG9O00559 213 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-210ENST00000487548 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
SENP6-210ENST00000487548 SEPT4O43236 478 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-210ENST00000487548 MYL1P05976 194 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-210ENST00000487548 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
SENP6-210ENST00000487548 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
SENP6-210ENST00000487548 DCTP40126 519 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-210ENST00000487548 EFNA5P52803 228 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-210ENST00000487548 TNFAIP2Q03169 654 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-210ENST00000487548 ENPP2Q13822 863 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-210ENST00000487548 PTK2BQ14289 1009 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-210ENST00000487548 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
SENP6-210ENST00000487548 CCDC181Q5TID7 509 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-210ENST00000487548 SULT6B1Q6IMI4 303 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-210ENST00000487548 FAM171BQ6P995 826 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-210ENST00000487548 IL20RBQ6UXL0 311 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-210ENST00000487548 RINLQ6ZS11 566 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-210ENST00000487548 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
SENP6-210ENST00000487548 OR2AK2Q8NG84 335 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-210ENST00000487548 CEP70Q8NHQ1 597 aa2.65□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms