RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483409.1

SSR1-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 1, human

TSL 4

Gene SSR1, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR1-208	ENST00000483409	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	GLOD4	Q9HC38	313 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409		A0A0J9YYE9	177 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	CFAP69	A5D8W1	941 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	MTSS1	O43312	755 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	SDC3	O75056	442 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	KCNK5	O95279	499 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	PRL	P01236	227 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	TRBC1	P01850	177 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	RBP3	P10745	1247 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	GM2A	P17900	193 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	LHCGR	P22888	699 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	RBL1	P28749	1068 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	HNF1B	P35680	557 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	PFN3	P60673	137 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	GALNT3	Q14435	633 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	PCSK7	Q16549	785 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	ZNF567	Q8N184	647 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	OXR1	Q8N573	874 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	SCRN2	Q96FV2	425 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	SLC32A1	Q9H598	525 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	GPR27	Q9NS67	375 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	UBP1	Q9NZI7	540 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	YKT6	O15498	198 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	PCDHGA12	O60330	932 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	ITGAV	P06756	1048 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	NFKB1	P19838	968 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	BNIP3	Q12983	259 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	ARHGEF7	Q14155	803 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	AGER	Q15109	404 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	RPS6KA1	Q15418	735 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	QPCT	Q16769	361 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	LRRC66	Q68CR7	880 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	PID1	Q7Z2X4	250 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	NUS1	Q96E22	293 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	CAPN8	A6NHC0	703 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	KCNN4	O15554	427 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	FLRT2	O43155	660 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	PMPCB	O75439	489 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	CEACAM1	P13688	526 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	ETV3	P41162	512 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	RXRG	P48443	463 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	THOP1	P52888	689 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	FZD2	Q14332	565 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	INPP5A	Q14642	412 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	TTC13	Q8NBP0	860 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	TRIM58	Q8NG06	486 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	SAP25	Q8TEE9	199 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	TADA1	Q96BN2	335 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	DTD2	Q96FN9	168 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	IFT43	Q96FT9	208 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	COQ10A	Q96MF6	247 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	TRIB3	Q96RU7	358 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	VAT1	Q99536	393 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR1-208	ENST00000483409	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26

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