RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 TOR1BO14657 336 aa21.01■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 KRT86O43790 486 aa21.01■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 ALPIP09923 528 aa21.01■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 CTPS1P17812 591 aa21.01■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 LHCGRP22888 699 aa21.01■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 NFKBIAP25963 317 aa21.01■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 GRK6P43250 576 aa21.01■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 YPEL5P62699 121 aa21.01■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 IFT43Q96FT9 208 aa21.01■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 TEKT5Q96M29 485 aa21.01■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 PCDH9Q9HC56 1237 aa21.01■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 LRRK1Q38SD2 2015 aa21■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 A0A0J9YYE9 177 aa21■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 HACD1B0YJ81 288 aa21■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 SDC3O75056 442 aa21■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 TRBC1P01850 177 aa21■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 HNF1BP35680 557 aa21■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 INPP5AQ14642 412 aa21■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 ACOX1Q15067 660 aa21■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 NOMO1Q15155 1222 aa21■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 ZNF542PQ5EBM4 170 aa21■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 USP45Q70EL2 814 aa21■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 TSPAN33Q86UF1 283 aa21■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 NDUFAF2Q8N183 169 aa21■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A45Q8N413 288 aa21■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 UBL4BQ8N7F7 174 aa21■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 PLA2G15Q8NCC3 412 aa21■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 TADA1Q96BN2 335 aa21■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 HES6Q96HZ4 224 aa21■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP21■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP21■□□□□ 0.953e-13■□□□□ 8.7
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A51Q9H1U9 297 aa21■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 GLOD4Q9HC38 313 aa21■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 A0A0U1RQS6 177 aa20.99■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA8CPA6NN73 597 aa20.99■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 PCCBP05166 539 aa20.99■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 CA4P22748 312 aa20.99■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 CD68P34810 354 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 CETN2P41208 172 aa20.99■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 RPL26P61254 145 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 XRCC4Q13426 336 aa20.99■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 MTM1Q13496 603 aa20.99■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 CRTC1Q6UUV9 634 aa20.99■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 ZNF662Q6ZS27 426 aa20.99■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa20.99■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 GLRX5Q86SX6 157 aa20.99■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 PARGQ86W56 976 aa20.99■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 LPCAT1Q8NF37 534 aa20.99■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 ACTL9Q8TC94 416 aa20.99■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 HTR3CQ8WXA8 447 aa20.99■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 CDC6Q99741 560 aa20.99■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 APOOQ9BUR5 198 aa20.99■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 DNAJC28Q9NX36 388 aa20.99■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 KLF15Q9UIH9 416 aa20.99■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 PSMD11O00231 422 aa20.98■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 MTSS1O43312 755 aa20.98■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 PIAS2O75928 621 aa20.98■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 CSF2P04141 144 aa20.98■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 CCDC175P0C221 793 aa20.98■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 DGKAP23743 735 aa20.98■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 PMLP29590 882 aa20.98■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 THOP1P52888 689 aa20.98■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 EPHB1P54762 984 aa20.98■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 QPCTQ16769 361 aa20.98■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 CCDC181Q5TID7 509 aa20.98■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 DENND2CQ68D51 928 aa20.98■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 PELI3Q8N2H9 469 aa20.98■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 TRIB3Q96RU7 358 aa20.98■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 C10orf88Q9H8K7 445 aa20.98■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 UCKL1Q9NWZ5 548 aa20.98■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 H7C0C1 242 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 TJP3O95049 919 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 NME1P15531 152 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 ETV3P41162 512 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 ATP5OP48047 213 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 PTSQ03393 145 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 ARHGEF7Q14155 803 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 PTK2BQ14289 1009 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 SLC14A2Q15849 920 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 INAVAQ3KP66 663 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 LRRC66Q68CR7 880 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 ZNF567Q8N184 647 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 EID2Q8N6I1 236 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 SPATA22Q8NHS9 363 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 DTD2Q96FN9 168 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 LYSMD1Q96S90 227 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 VAT1Q99536 393 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 LZTFL1Q9NQ48 299 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 OR1A2Q9Y585 309 aa20.97■□□□□ 0.95
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