RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	C4orf47	A7E2U8	309 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	TM4SF5	O14894	197 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	WNT9A	O14904	365 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	PCDHGA12	O60330	932 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	NDST3	O95803	873 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	THEGL	P0DJG4	465 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	TEAD1	P28347	426 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	RXRG	P48443	463 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	CCT8	P50990	548 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	PFN3	P60673	137 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	CDK18	Q07002	472 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	MTM1	Q13496	603 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	ARHGEF7	Q14155	803 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	KLK6	Q92876	244 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	RTP4	Q96DX8	246 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	BMF	Q96LC9	184 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	COQ10A	Q96MF6	247 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	SPATA13	Q96N96	652 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	TRIB3	Q96RU7	358 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	CEP41	Q9BYV8	373 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		14.66	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	CES2	O00748	559 aa		14.66	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	RAD51B	O15315	384 aa		14.66	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	KCNN4	O15554	427 aa		14.66	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	PYGL	P06737	847 aa		14.66	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	ITIH2	P19823	946 aa		14.66	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	NFKB1	P19838	968 aa		14.66	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	GEM	P55040	296 aa		14.66	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	PTK2B	Q14289	1009 aa		14.66	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	CNGA3	Q16281	694 aa		14.66	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		14.66	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		14.66	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		14.66	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		14.66	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		14.66	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		14.66	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	NLRP8	Q86W28	1048 aa		14.66	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		14.66	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		14.66	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	LRRC45	Q96CN5	670 aa		14.66	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	PBK	Q96KB5	322 aa		14.66	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		14.66	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	FZD3	Q9NPG1	666 aa		14.66	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	KCND1	Q9NSA2	647 aa		14.66	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		14.66	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1B0GTQ1	180 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	POM121B	A6NF01	834 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241		H0Y8X5	98 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	LIAS	O43766	372 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	GCAT	O75600	419 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	HLA-DPA1	P20036	260 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	LHCGR	P22888	699 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	HNF1B	P35680	557 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	IGFALS	P35858	605 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	ID4	P47928	161 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	DPT	Q07507	201 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	PRPSAP1	Q14558	356 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	IRF4	Q15306	451 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	CCNG2	Q16589	344 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	QPCT	Q16769	361 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	P3H1	Q32P28	736 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	INAVA	Q3KP66	663 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	KDELC1	Q6UW63	502 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	LAYN	Q6UX15	382 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241		Q6ZSR6	202 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	OR13H1	Q8NG92	308 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	ATL2	Q8NHH9	583 aa		14.65	□□□□□ -0.06

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