RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434333.1

HLA-B-250, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-250ENST00000434333 CAPN11Q9UMQ6 739 aa20.18■□□□□ 0.82
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HLA-B-250ENST00000434333 DOLKQ9UPQ8 538 aa20.18■□□□□ 0.82
HLA-B-250ENST00000434333 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa20.18■□□□□ 0.82
HLA-B-250ENST00000434333 PMS2P1A4D2B8 440 aa20.17■□□□□ 0.82
HLA-B-250ENST00000434333 SOCS5O75159 536 aa20.17■□□□□ 0.82
HLA-B-250ENST00000434333 GYPCP04921 128 aa20.17■□□□□ 0.82
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HLA-B-250ENST00000434333 ERVPABLB-1P60509 514 aa20.17■□□□□ 0.82
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HLA-B-250ENST00000434333 CPLX3Q8WVH0 158 aa20.17■□□□□ 0.82
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HLA-B-250ENST00000434333 DTD2Q96FN9 168 aa20.13■□□□□ 0.81
HLA-B-250ENST00000434333 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
HLA-B-250ENST00000434333 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa20.13■□□□□ 0.81
HLA-B-250ENST00000434333 IFNKQ9P0W0 207 aa20.13■□□□□ 0.81
HLA-B-250ENST00000434333 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
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